More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2567 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2567  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 507 aa  1003    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275493 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  66.35 
 
 		 525 aa  684    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2384  amino acid permease-associated region  69.52 
 
 		 518 aa  645    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.402999 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1589  amino acid permease-associated region  65.27 
 
 		 539 aa  614  1e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.984032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  57.17 
 
 		 481 aa  504  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03227  amino acid transporter  47.55 
 
 		 543 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1760  amino acid permease-associated region  47.38 
 
 		 480 aa  402  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1827  amino acid transporter  47.18 
 
 		 480 aa  403  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  47.81 
 
 		 478 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  45.28 
 
 		 476 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  42.34 
 
 		 494 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  46.36 
 
 		 476 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  44.62 
 
 		 549 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  43.82 
 
 		 483 aa  383  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4031  amino acid permease-associated region  44.58 
 
 		 475 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  45.74 
 
 		 476 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  46.2 
 
 		 466 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  43.43 
 
 		 496 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  46.53 
 
 		 466 aa  382  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  46.76 
 
 		 471 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  44.53 
 
 		 468 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  42.2 
 
 		 506 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  44.53 
 
 		 468 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  46.01 
 
 		 466 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  44.53 
 
 		 468 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  46 
 
 		 467 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  41.45 
 
 		 486 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  44.11 
 
 		 468 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  41.45 
 
 		 486 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  46 
 
 		 467 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  46 
 
 		 467 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  45.79 
 
 		 467 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  44.84 
 
 		 476 aa  372  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  45.79 
 
 		 467 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  45.82 
 
 		 465 aa  372  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  45.79 
 
 		 467 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  45.79 
 
 		 467 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  42.36 
 
 		 489 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  45.79 
 
 		 467 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  43.83 
 
 		 467 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  43.03 
 
 		 488 aa  368  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  41.58 
 
 		 471 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  41.58 
 
 		 471 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  43.24 
 
 		 467 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  41.58 
 
 		 471 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  41.58 
 
 		 471 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  43.24 
 
 		 467 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  41.41 
 
 		 471 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  46.41 
 
 		 465 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  41.58 
 
 		 471 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  43.24 
 
 		 467 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  43.65 
 
 		 467 aa  365  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  43.24 
 
 		 467 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  43.8 
 
 		 469 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  43.24 
 
 		 467 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  41.58 
 
 		 471 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  43.79 
 
 		 467 aa  365  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  43.24 
 
 		 467 aa  365  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  43.56 
 
 		 467 aa  364  2e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  41.37 
 
 		 471 aa  365  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  44.91 
 
 		 476 aa  363  3e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00849  cationic amino acid transporter  44.91 
 
 		 476 aa  363  3e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000255765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  40.96 
 
 		 471 aa  362  6e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  43.94 
 
 		 491 aa  362  7.0000000000000005e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  40.24 
 
 		 471 aa  362  8e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  44.03 
 
 		 466 aa  361  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  44.14 
 
 		 463 aa  360  3e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  42.29 
 
 		 518 aa  360  3e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  44.23 
 
 		 463 aa  360  5e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  43.08 
 
 		 495 aa  359  5e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  41.16 
 
 		 471 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  43.2 
 
 		 495 aa  356  5e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  40.36 
 
 		 496 aa  355  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  40.36 
 
 		 496 aa  355  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  43.41 
 
 		 438 aa  352  7e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  43.51 
 
 		 463 aa  352  8e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  38.49 
 
 		 471 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  38.49 
 
 		 471 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  38.49 
 
 		 471 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1704  amino acid permease-associated region  47.89 
 
 		 465 aa  351  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162739  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  39.1 
 
 		 471 aa  349  7e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  43.03 
 
 		 471 aa  349  7e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  43.03 
 
 		 471 aa  349  7e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  38.29 
 
 		 471 aa  349  7e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  44.19 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  38.9 
 
 		 471 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  42.4 
 
 		 471 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  42.4 
 
 		 471 aa  347  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  45.87 
 
 		 481 aa  347  2e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  38.7 
 
 		 471 aa  347  3e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  41.34 
 
 		 486 aa  347  4e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  42.33 
 
 		 474 aa  346  6e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1784  amino acid permease-associated region  45.3 
 
 		 475 aa  346  7e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  38.29 
 
 		 471 aa  345  8e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  45.63 
 
 		 501 aa  345  8e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  43.22 
 
 		 495 aa  345  1e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  43.11 
 
 		 496 aa  345  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  38.72 
 
 		 471 aa  344  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  41.73 
 
 		 494 aa  344  2e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  40.86 
 
 		 500 aa  344  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>