More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1089 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1089  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 		 345 aa  692    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.940602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0073  delta-aminolevulinic acid dehydratase  77.74 
 
 		 330 aa  484  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2737  delta-aminolevulinic acid dehydratase  75 
 
 		 332 aa  473  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2897  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.63 
 
 		 335 aa  398  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.713328  hitchhiker  0.000481254 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2988  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.7 
 
 		 350 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4655  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.27 
 
 		 352 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213892  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0266  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.23 
 
 		 335 aa  391  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.73 
 
 		 351 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4238  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.73 
 
 		 351 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.658364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.71 
 
 		 343 aa  391  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.019556 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0261  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.23 
 
 		 335 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0430723  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0327  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.86 
 
 		 335 aa  391  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1909  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.18 
 
 		 352 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.92 
 
 		 363 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5631  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.62 
 
 		 352 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.0746004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2651  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.33 
 
 		 352 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.29 
 
 		 378 aa  389  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.236795  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3352  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.86 
 
 		 331 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal  0.803387 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0181  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.05 
 
 		 331 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3924  Porphobilinogen synthase  60.43 
 
 		 329 aa  385  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0861463  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7570  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.83 
 
 		 350 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.578542  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4758  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.77 
 
 		 351 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0316  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.39 
 
 		 335 aa  384  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4105  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.28 
 
 		 338 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0404345 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3382  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.67 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0380  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.37 
 
 		 355 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0192  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.68 
 
 		 338 aa  383  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.949773 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0518  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.98 
 
 		 338 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.151738 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2601  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.85 
 
 		 354 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3746  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.85 
 
 		 354 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3139  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.85 
 
 		 362 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3038  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.59 
 
 		 362 aa  378  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2623  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.45 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.660287  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0374  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.12 
 
 		 335 aa  378  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000361568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2660  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.76 
 
 		 350 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.397348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3211  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.19 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6834  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.83 
 
 		 350 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3801  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.06 
 
 		 336 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3477  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.59 
 
 		 332 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691309 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3508  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.9 
 
 		 332 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1954  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.9 
 
 		 332 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1208  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.06 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.4 
 
 		 336 aa  378  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4219  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.46 
 
 		 333 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1172  Porphobilinogen synthase  58.79 
 
 		 336 aa  375  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.59 
 
 		 332 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3716  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.59 
 
 		 332 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3774  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.56 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.81 
 
 		 321 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.214609 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4926  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.08 
 
 		 329 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000159734  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0245  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.65 
 
 		 349 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.963714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3286  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.32 
 
 		 330 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2729  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.28 
 
 		 332 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.28 
 
 		 332 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.214853  normal  0.272412 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0378  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.28 
 
 		 332 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1498  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.09 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001919  porphobilinogen synthase  57.01 
 
 		 354 aa  371  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.874954  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1907  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.13 
 
 		 340 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3149  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.98 
 
 		 330 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2920  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.59 
 
 		 331 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259754 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3938  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.13 
 
 		 340 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47450  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.77 
 
 		 337 aa  368  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0080  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.49 
 
 		 342 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000790962 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0357  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.49 
 
 		 321 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1547  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.12 
 
 		 326 aa  369  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.168411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0278  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.13 
 
 		 340 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5987  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.82 
 
 		 337 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2413  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.79 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852272  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2793  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.8 
 
 		 334 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286229  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2989  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.59 
 
 		 331 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0118  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.07 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4295  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.14 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.19 
 
 		 352 aa  367  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162764  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2464  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.92 
 
 		 335 aa  365  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.23 
 
 		 332 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0113422 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3004  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.07 
 
 		 338 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.926977  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4208  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.28 
 
 		 336 aa  364  1e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0388  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.23 
 
 		 358 aa  364  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.51 
 
 		 337 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02814  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.37 
 
 		 320 aa  363  2e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1546  Porphobilinogen synthase  56.31 
 
 		 353 aa  363  2e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2848  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.48 
 
 		 334 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3904  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.98 
 
 		 335 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3267  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.62 
 
 		 331 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0833553 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3560  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.28 
 
 		 336 aa  364  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917412 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3734  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.28 
 
 		 336 aa  364  2e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0422  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.98 
 
 		 335 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000528265 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.98 
 
 		 335 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3805  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.73 
 
 		 338 aa  363  3e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000100968  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0436  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.67 
 
 		 335 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1445  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.48 
 
 		 334 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0396  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.98 
 
 		 336 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.13 
 
 		 343 aa  362  6e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0497  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.98 
 
 		 335 aa  362  6e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.33 
 
 		 334 aa  362  6e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0083  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.85 
 
 		 341 aa  362  7.0000000000000005e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0255  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.67 
 
 		 340 aa  361  9e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20808 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0812  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.5 
 
 		 337 aa  361  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.67 
 
 		 340 aa  361  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3613  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.69 
 
 		 332 aa  360  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00143981  hitchhiker  0.00000000944676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>