More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1021 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1021  cytochrome P450  100 
 
 
415 aa  818    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0644973 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1964  cytochrome P450  38.02 
 
 
421 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.512147  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1274  hypothetical protein  33.5 
 
 
461 aa  205  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  33.59 
 
 
399 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5317  cytochrome P450  32.36 
 
 
451 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4880  cytochrome P450  33.41 
 
 
450 aa  202  9e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1259  cytochrome P450  33.41 
 
 
448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.922035  hitchhiker  0.00766496 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  33.69 
 
 
399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4936  cytochrome P450  31.87 
 
 
451 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5024  cytochrome P450  31.87 
 
 
451 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6858  cytochrome P450  34.34 
 
 
412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244817  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1854  cytochrome P450  33.25 
 
 
449 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259336  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  36.51 
 
 
390 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3899  cytochrome P450  34.66 
 
 
407 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260243  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5443  cytochrome P450  33.51 
 
 
418 aa  189  9e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372727  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3680  cytochrome P450  31.12 
 
 
457 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3753  cytochrome P450  31.12 
 
 
457 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.821382  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3693  cytochrome P450  31.12 
 
 
457 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452097  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2498  cytochrome P450  31.01 
 
 
471 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  33.51 
 
 
388 aa  187  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  32.32 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  35.01 
 
 
399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4160  cytochrome P450  30.53 
 
 
456 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4131  cytochrome P450  30.15 
 
 
406 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  31.7 
 
 
402 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1768  cytochrome P450  32.3 
 
 
405 aa  179  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  31.3 
 
 
380 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  31.96 
 
 
403 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0997  cytochrome P450  30.25 
 
 
400 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.148456  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  33.42 
 
 
398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  32.01 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  29.97 
 
 
398 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  34.78 
 
 
418 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  35.58 
 
 
406 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  32.38 
 
 
404 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  32.38 
 
 
404 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  32.38 
 
 
404 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4979  cytochrome P450  31.96 
 
 
406 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  32.52 
 
 
398 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  32.9 
 
 
401 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  31.67 
 
 
407 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  33.85 
 
 
398 aa  170  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7865  cytochrome P450-terp  33.74 
 
 
433 aa  170  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.790452  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  36.68 
 
 
406 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5052  cytochrome P450  32.73 
 
 
416 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13551  cytochrome P450 monooxygenase 142 cyp142  31.55 
 
 
398 aa  167  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000578642  hitchhiker  0.0000082188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1010  cytochrome P450  31.46 
 
 
428 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1037  cytochrome P450  31.46 
 
 
416 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0986307  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1027  cytochrome P450  31.46 
 
 
416 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.810593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  31.95 
 
 
412 aa  166  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2229  cytochrome P450  33.68 
 
 
412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11282  cytochrome P450 130 cyp130  32.97 
 
 
405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.112897  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  34.15 
 
 
413 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  34.47 
 
 
426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  32.51 
 
 
409 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  36.31 
 
 
395 aa  162  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5053  cytochrome P450  32.73 
 
 
419 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4176  cytochrome P450  29.41 
 
 
397 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  33.42 
 
 
413 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  35.1 
 
 
390 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  36.55 
 
 
412 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  32.42 
 
 
404 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  36.25 
 
 
395 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1478  hypothetical protein  30.36 
 
 
403 aa  160  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  33.72 
 
 
774 aa  160  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  29.84 
 
 
412 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4565  cytochrome P450  34.76 
 
 
402 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4653  cytochrome P450  34.76 
 
 
402 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.974362  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4948  cytochrome P450  34.76 
 
 
402 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169294 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  27.88 
 
 
418 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  33.52 
 
 
398 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  36.01 
 
 
419 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  32.17 
 
 
408 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  29.49 
 
 
411 aa  158  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  29.49 
 
 
411 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1009  cytochrome P450  32.22 
 
 
420 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  33.16 
 
 
406 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  32.27 
 
 
404 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  29.03 
 
 
411 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1026  cytochrome P450  32.22 
 
 
420 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.60659 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  32.27 
 
 
404 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1036  cytochrome P450  32.22 
 
 
420 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1302  cytochrome P450  30.67 
 
 
420 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  28.04 
 
 
411 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  32.27 
 
 
404 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4221  cytochrome P450  33.06 
 
 
403 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3962  cytochrome P450  33.72 
 
 
398 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4036  cytochrome P450  33.72 
 
 
398 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  32.72 
 
 
417 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3976  cytochrome P450  33.72 
 
 
398 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424907  normal  0.0390566 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  31.16 
 
 
409 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  30.53 
 
 
398 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  28.76 
 
 
411 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  28.76 
 
 
411 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  31.44 
 
 
396 aa  155  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  34.47 
 
 
398 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2021  cytochrome P450  32.08 
 
 
428 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  34.11 
 
 
401 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  27.89 
 
 
411 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4405  cytochrome P450  28.75 
 
 
447 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>