More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_30090 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_30090  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  100 
 
 
553 aa  1103    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.492934  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3087  thiamine pyrophosphate protein central region  55.13 
 
 
564 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2248  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  49.01 
 
 
571 aa  440  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  31.87 
 
 
567 aa  250  5e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2040  hypothetical protein  34.05 
 
 
535 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463751  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.51 
 
 
563 aa  237  4e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.75 
 
 
569 aa  236  8e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  33.58 
 
 
566 aa  236  8e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2183  hypothetical protein  33.79 
 
 
535 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0086  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.33 
 
 
574 aa  232  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00079  acetolactate synthase III large subunit  33.33 
 
 
574 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00078  hypothetical protein  33.33 
 
 
574 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5385  hypothetical protein  33.13 
 
 
542 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366398  normal  0.452356 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.53 
 
 
604 aa  230  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0079  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.33 
 
 
574 aa  230  5e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3522  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.33 
 
 
574 aa  229  7e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3580  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.33 
 
 
574 aa  229  7e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.33 
 
 
574 aa  230  7e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.630637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.49 
 
 
557 aa  229  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  31.19 
 
 
587 aa  229  1e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.74 
 
 
561 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.9 
 
 
557 aa  228  2e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  31.56 
 
 
587 aa  227  4e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0538  hypothetical protein  32.53 
 
 
530 aa  226  9e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  31.11 
 
 
587 aa  225  2e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3605  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.99 
 
 
572 aa  225  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.19 
 
 
575 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2932  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.19 
 
 
593 aa  225  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.19 
 
 
575 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1932  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.9 
 
 
554 aa  224  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  28.72 
 
 
599 aa  224  4e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3793  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.81 
 
 
572 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.07 
 
 
572 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.57 
 
 
569 aa  223  7e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.75 
 
 
573 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0852  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.55 
 
 
552 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.579609  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.15 
 
 
557 aa  222  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0634  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.94 
 
 
573 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0951931  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.32 
 
 
554 aa  221  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0624  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.37 
 
 
574 aa  221  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.146468 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.68 
 
 
556 aa  220  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.18 
 
 
563 aa  219  7e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.51 
 
 
555 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0428  acetolactate synthase  31.14 
 
 
583 aa  219  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1973  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.87 
 
 
572 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417395  hitchhiker  0.0000255584 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.77 
 
 
554 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.49 
 
 
561 aa  219  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  30.53 
 
 
587 aa  218  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2840  hypothetical protein  32.9 
 
 
545 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2374  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.87 
 
 
572 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343911  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.87 
 
 
572 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1955  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.29 
 
 
618 aa  217  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1776  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.29 
 
 
573 aa  217  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.56 
 
 
574 aa  217  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0968  thiamine pyrophosphate protein central region  32.55 
 
 
563 aa  216  7e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.84 
 
 
565 aa  216  7e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001649  acetolactate synthase large subunit  30.33 
 
 
574 aa  216  7e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546971  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2138  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.23 
 
 
572 aa  216  7e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.803808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1419  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.34 
 
 
587 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1281  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.34 
 
 
587 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1274  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.34 
 
 
587 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.87 
 
 
573 aa  216  9e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1045  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.34 
 
 
587 aa  216  9e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.160852  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.1 
 
 
566 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05521  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.28 
 
 
587 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.03 
 
 
566 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1628  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.03 
 
 
572 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1296  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.16 
 
 
563 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4471  hypothetical protein  32.29 
 
 
545 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.658207  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0522  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.81 
 
 
570 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.96739  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1233  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  31 
 
 
627 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506  normal  0.463621 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.28 
 
 
558 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1905  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  29.91 
 
 
573 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0526  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.65 
 
 
587 aa  214  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.65 
 
 
573 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302703  decreased coverage  0.000148215 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2018  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.89 
 
 
573 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.801766  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.29 
 
 
553 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.21 
 
 
593 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0892  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.79 
 
 
581 aa  214  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.806334  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0745  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.79 
 
 
581 aa  214  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.425404  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0634  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.87 
 
 
567 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.876407  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1693  hypothetical protein  32.23 
 
 
541 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.08 
 
 
552 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1848  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.15 
 
 
587 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0396  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.15 
 
 
587 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1750  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.41 
 
 
572 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524546  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1830  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.41 
 
 
572 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0753  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.15 
 
 
587 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1113  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.15 
 
 
587 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.5 
 
 
570 aa  213  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0527  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.62 
 
 
608 aa  213  7e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.5 
 
 
570 aa  213  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.5 
 
 
570 aa  213  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.12 
 
 
558 aa  213  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1328  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.73 
 
 
587 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0958781 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  28.21 
 
 
542 aa  213  7.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0132  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.58 
 
 
584 aa  213  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.084297 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0853  acetolactate synthase, large subunit  29.45 
 
 
573 aa  213  7.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.640805  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.77 
 
 
572 aa  213  9e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.1 
 
 
572 aa  213  9e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>