161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21960 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_21960  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  100 
 
 		 107 aa  216  8.999999999999998e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148281  normal  0.304965 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  56.9 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  56.9 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  56.9 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  48.61 
 
 		 82 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  65.22 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12129  twin arginine translocase protein A  48.28 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119011  normal  0.626487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  59.09 
 
 		 86 aa  71.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3980  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.95 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368125  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2468  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.87 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.134961  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2607  twin arginine-targeting protein translocase  56.25 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181166  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6972  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.08 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2370  twin arginine translocase protein A  45.24 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.730984  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1926  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.64 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000393248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2060  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.22 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.220179  normal  0.159543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4869  twin arginine-targeting protein translocase  54.17 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.115935 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2252  twin arginine translocase protein A  49.32 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118258  normal  0.775201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4453  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  normal  0.0943376 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3893  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000775372  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1780  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.7 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000204006  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1882  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1252  twin argininte translocase protein A  43.75 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2251  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.1 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.624721  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3667  twin arginine-targeting protein translocase  59.46 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1204  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  51.28 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1869  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  49.15 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0618577  normal  0.146406 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0781  twin arginine translocase protein A  30.86 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0308647 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1290  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.35 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0069  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  49.15 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  42.22 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  35.38 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0814  twin arginine translocase protein A  29.63 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0320  twin arginine-targeting protein translocase  27.78 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18530  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  56.25 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0332142  decreased coverage  0.00893017 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0744  twin arginine translocase protein A  29.63 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632356  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  40 
 
 		 71 aa  50.4  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1503  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.89 
 
 		 121 aa  50.1  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.432776  hitchhiker  0.000608688 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1053  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5554  twin arginine translocase protein A  34.15 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.80239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5859  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  53.85 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  32.47 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2183  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00719783  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  28.95 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3045  Sec-independent protein translocase protein TatA  32.26 
 
 		 79 aa  47.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0706  twin arginine translocase protein A  28.57 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.121051  normal  0.444547 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  35.38 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4378  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.95 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.600878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2671  twin arginine translocase protein A  34.29 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0436  twin arginine translocase protein A  34.29 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.510795  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0415  twin arginine translocase protein A  34.29 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00507108 
 
 
-
 
NC_002978  WD0152  mttA/Hcf106 family protein  32.2 
 
 		 55 aa  47  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  41.82 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0442  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  30.77 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2323  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.9 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.405896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0409  twin arginine translocase protein A  32.86 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0593  twin arginine-targeting protein translocase  27.27 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0778682  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2319  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.84 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3898  twin arginine-targeting protein translocase  30.77 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0503  twin arginine-targeting protein translocase  30.77 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0981  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  26.79 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0416  twin arginine-targeting protein translocase  30.77 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0428  twin arginine-targeting protein translocase  30.77 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000041421 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0244  twin-arginine translocation protein TatA/E  31.03 
 
 		 56 aa  45.4  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.317121  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2689  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  39.19 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3376  twin arginine-targeting protein translocase  28.92 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0852423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1180  twin arginine translocase protein A  35.56 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3549  twin arginine translocase protein A  31.43 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0475634  hitchhiker  0.000865371 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1769  twin-arginine translocation protein TatA/E  55.26 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506415  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4204  twin arginine translocase protein A  29.55 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4181  twin arginine translocase protein A  29.55 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4360  twin arginine translocase protein A  29.55 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0354  twin arginine translocase protein A  32.35 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4300  twin arginine translocase protein A  29.55 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4253  twin arginine translocase protein A  29.55 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0363  twin arginine translocase protein A  32.35 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03729  twin arginate translocase protein A  37.78 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4143  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.78 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2748  twin arginine translocase protein A  30.43 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4308  twin arginine translocase protein A  37.78 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5277  twin arginine translocase protein A  37.78 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274389  normal  0.174664 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2305  twin arginine translocase protein A  55.17 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0188826  normal  0.0162961 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0974  Sec-independent protein translocase TatA  27.55 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.450939  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03678  hypothetical protein  37.78 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.78 
 
 		 189 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3957  twin arginine translocase protein A  37.78 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0707519 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4060  twin arginine translocase protein A  37.78 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4357  twin arginine translocase protein A  37.78 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4172  twin arginine translocase protein A  37.78 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4219  twin arginine translocase protein A  37.78 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000534465 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2703  twin arginine translocase protein A  31.94 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3682  twin arginine translocase protein A  31.94 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.759225  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3250  twin arginine translocase protein A  31.94 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1799  twin arginine translocase protein A  31.94 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3655  twin arginine translocase protein A  31.94 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3713  twin arginine translocase protein A  31.94 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2754  twin arginine translocase protein A  31.94 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0395  twin arginine-targeting protein translocase  36 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0405  twin arginine-targeting protein translocase  36 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.019238  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0339  twin arginine translocase protein A  30.88 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11873  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4202  Sec-independent protein translocase protein TatA  32.58 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>