More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_15390 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_15390  transcriptional regulator  100 
 
 		 277 aa  546  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.457467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  55.83 
 
 		 254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  42.92 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  44.02 
 
 		 246 aa  165  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  40.52 
 
 		 243 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  42.62 
 
 		 246 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  38.3 
 
 		 247 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  40.17 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  37.17 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 248 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  40 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  39.73 
 
 		 244 aa  139  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 225 aa  139  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 268 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3517  GntR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  39.06 
 
 		 244 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 239 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  36.13 
 
 		 246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 248 aa  129  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  36.4 
 
 		 252 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 249 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  38.72 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  38.66 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  37.83 
 
 		 252 aa  122  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3001  transcriptional regulator, GntR family  40.77 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00183379 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  31.38 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  34.73 
 
 		 244 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 195 aa  119  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 195 aa  119  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  37.83 
 
 		 257 aa  118  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05080  transcriptional regulator  36.61 
 
 		 259 aa  118  9e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.764166  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3959  GntR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 219 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0354607  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 248 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  36.64 
 
 		 248 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  37.39 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.596979 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5638  transcriptional regulator, GntR family  38.03 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  38.08 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  38.17 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.253888 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 244 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 244 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 244 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  41.23 
 
 		 244 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 244 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 244 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 244 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  29.96 
 
 		 233 aa  112  7.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  33.05 
 
 		 260 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 248 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 248 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 248 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  37.45 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 258 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 258 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 248 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5851  GntR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.571197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  34.3 
 
 		 242 aa  109  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 244 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 244 aa  109  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 239 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  33.66 
 
 		 232 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 257 aa  108  8.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 235 aa  108  9.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 244 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>