66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11120 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11120  predicted metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold protein  100 
 
 		 287 aa  595  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.396729  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2328  TatD-related deoxyribonuclease  73.43 
 
 		 291 aa  434  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0111836  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0430  TatD-related deoxyribonuclease  51.38 
 
 		 328 aa  330  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.340827  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7264  TatD-related deoxyribonuclease  53.1 
 
 		 328 aa  326  3e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00204117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2285  TatD-related deoxyribonuclease  55.02 
 
 		 307 aa  325  6e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232496 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0159  TatD-related deoxyribonuclease  53.98 
 
 		 310 aa  322  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0719337  hitchhiker  0.00000000000886366 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0991  TatD-related deoxyribonuclease  54.01 
 
 		 380 aa  318  5e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2882  TatD-related deoxyribonuclease  50.34 
 
 		 342 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1549  TatD-related deoxyribonuclease  52.94 
 
 		 303 aa  303  2.0000000000000002e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.450153  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0778  TatD-related deoxyribonuclease  44.23 
 
 		 266 aa  236  4e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2432  TatD-related deoxyribonuclease  39.85 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1818  TatD-related deoxyribonuclease  39.1 
 
 		 267 aa  208  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1555  TatD-related deoxyribonuclease  41.04 
 
 		 277 aa  206  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0988  TatD-related deoxyribonuclease  41.29 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.981061 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2472  TatD-related deoxyribonuclease  38.64 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.847165  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1205  TatD-related deoxyribonuclease  29.96 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1417  TatD-related deoxyribonuclease  26.85 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1429  TatD-related deoxyribonuclease  29.96 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.123471  normal  0.114014 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0479  TatD-related deoxyribonuclease  29.96 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.671319  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1220  TatD-related deoxyribonuclease  26.46 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0197  TatD-related deoxyribonuclease  27.34 
 
 		 254 aa  101  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00720719  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0961  TatD-related deoxyribonuclease  27.03 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0537  TatD-related deoxyribonuclease  24.9 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2017  TatD-related deoxyribonuclease  31.38 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4096  TatD-related deoxyribonuclease  29.25 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000024322  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0471  TatD-related deoxyribonuclease  28.73 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424562  normal  0.608215 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3953  TatD-related deoxyribonuclease  28.27 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4063  TatD-related deoxyribonuclease  26.79 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.328978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  24.02 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  24.45 
 
 		 256 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3799  TatD-related deoxyribonuclease  36.71 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  27.88 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  26.67 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  23.18 
 
 		 254 aa  47  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1355  TatD family hydrolase  24.74 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.300834  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  32 
 
 		 269 aa  47  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1991  TatD-related deoxyribonuclease  37.93 
 
 		 296 aa  46.2  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.126048  decreased coverage  0.0000779322 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  30.43 
 
 		 258 aa  45.8  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  26.67 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  33.33 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  22.22 
 
 		 228 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  33.33 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  43.33 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0206  Mg-dependent DNase  29.56 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000791491  normal  0.0173908 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  28.28 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  27.33 
 
 		 462 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  34.07 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  30.82 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  26 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  31.58 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  28.57 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  33.33 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  25 
 
 		 606 aa  43.5  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  33.33 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  33.33 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  33.33 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  33.33 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  33.33 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  33.33 
 
 		 265 aa  43.5  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0747  TatD family hydrolase  25.13 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  30.48 
 
 		 255 aa  42.7  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  30.93 
 
 		 263 aa  42.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  25.85 
 
 		 264 aa  42.4  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5476  hydrolase, TatD family  32.94 
 
 		 256 aa  42.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.230382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  28.3 
 
 		 256 aa  42.4  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>