171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10350 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_10350  predicted metalloprotease  100 
 
 		 322 aa  652    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.996596  normal  0.0302489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0857  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  43.4 
 
 		 302 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18507  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06840  predicted metalloprotease  34.26 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.219653  normal  0.038026 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0662  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  33.33 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0858  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  33.74 
 
 		 347 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0459016  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4325  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  36.64 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1467  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.62 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4034  metalloprotease-like protein  33.9 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096293  normal  0.0588825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6735  metalloprotease-like protein  29.12 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331634  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2919  metalloprotease  33.91 
 
 		 319 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2920  hypothetical protein  33.04 
 
 		 322 aa  97.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2846  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  34.32 
 
 		 517 aa  97.1  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3415  metalloprotease-like protein  28.46 
 
 		 353 aa  95.9  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154601  normal  0.658534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6736  metalloprotease-like protein  31.56 
 
 		 259 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550772  normal  0.186259 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4326  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.91 
 
 		 331 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1876  hypothetical protein  29.59 
 
 		 372 aa  87.4  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.425514  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0930  metalloprotease-like protein  28.51 
 
 		 341 aa  85.9  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1259  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  32.13 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109389  normal  0.980751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4616  metalloprotease-like protein  28.16 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2367  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.52 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39378  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2312  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  30.23 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000120651  normal  0.307835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4657  zinc metallopeptidase, putative  34.42 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0447  putative neutral zinc metallopeptidase  32.88 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00964466  normal  0.614722 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2040  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  30.91 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1250  metalloprotease-like protein  30.58 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1366  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.58 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3136  hypothetical protein  30.58 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2771  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.74 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4289  hypothetical protein  33.95 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1749  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  31.68 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.639669  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62420  hypothetical protein  32.81 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3115  hypothetical protein  30.23 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0633629  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5433  hypothetical protein  32.81 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07770  zinc metallopeptidase  34.29 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4913  hypothetical protein  34.42 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0109468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2086  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.72 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3868  zinc metallopeptidase putative  33.03 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06508  hypothetical protein  35.27 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0779  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  33.78 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.68402 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2503  hypothetical protein  29.96 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0194422 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1914  metalloprotease  30.52 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9317  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  34.21 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4657  metallopeptidase, zinc binding  31.95 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0442  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.44 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.893193 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1678  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.49 
 
 		 290 aa  72.4  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4519  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  33.49 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6586  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.29 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1643  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.7 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18536  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1265  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.05 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0872  hypothetical protein  29.19 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0161081  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1485  hypothetical protein  31.82 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3453  hypothetical protein  32.35 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2971  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  31.94 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4041  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  35.07 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000295256 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2970  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  33.54 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0222761 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25770  predicted metalloprotease  31.4 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3482  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.67 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5419  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.81 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2264  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.37 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0828  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  32.58 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2726  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  33.48 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2852  zinc protease  31.9 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4652  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  33.33 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4615  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.3 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4245  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.3 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2115  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.38 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1251  zinc protease  30.42 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00055946  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3535  hypothetical protein  31.25 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.995239 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3451  hypothetical protein  29.02 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0944  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.67 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158775  normal  0.0189489 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1722  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.32 
 
 		 282 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1850  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  32.5 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303807 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3879  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.9 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3296  hypothetical protein  31.86 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2745  zinc protease  31.43 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1515  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.84 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2631  zinc protease  31.43 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0936  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  34.68 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.367422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2679  zinc protease  31.43 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2719  zinc protease  31.43 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.884525  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0910  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  33.87 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0387284 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2313  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  32.8 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.33 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4616  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.5 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16102 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4250  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.34 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2331  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.9 
 
 		 295 aa  67  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.88553 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1156  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.57 
 
 		 300 aa  67  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.70598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3823  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.6 
 
 		 292 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2847  hypothetical protein  31.28 
 
 		 287 aa  67  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02367  hypothetical protein  31.28 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1194  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.28 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3697  hypothetical protein  31.28 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2606  hypothetical protein  31.28 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02329  hypothetical protein  31.28 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8759  hypothetical protein  28.5 
 
 		 261 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1201  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.28 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2622  hypothetical protein  31.28 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1147  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  28.24 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1681  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.8 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13420  predicted metalloprotease  29.22 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00442634  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>