More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_09840 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_09840  Mg chelatase-related protein  100 
 
 
503 aa  971    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5916  Mg chelatase, subunit ChlI  65.34 
 
 
506 aa  594  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000357839  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1642  Mg chelatase, subunit ChlI  61.28 
 
 
506 aa  542  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0110921  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12911  hypothetical protein  58.12 
 
 
503 aa  529  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000430198  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2203  Mg chelatase, subunit ChlI  57.92 
 
 
503 aa  501  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.869212  normal  0.31098 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1986  Mg chelatase-related protein  56.31 
 
 
503 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0373597  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1966  Mg chelatase, subunit ChlI  56.31 
 
 
503 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352304  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2032  Mg chelatase, subunit ChlI  56.31 
 
 
503 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.175464  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2096  Mg chelatase, subunit ChlI  55.76 
 
 
502 aa  483  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4139  Mg chelatase, subunit ChlI  55.91 
 
 
502 aa  479  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3414  Mg chelatase, subunit ChlI  53.42 
 
 
519 aa  477  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3585  Mg chelatase-related protein  52.67 
 
 
511 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3997  Mg chelatase, subunit ChlI  54.65 
 
 
506 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0232  Mg chelatase, subunit ChlI  52.85 
 
 
507 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0670  Mg chelatase-related protein  51.46 
 
 
514 aa  437  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1479  Mg chelatase, subunit ChlI  51.39 
 
 
505 aa  432  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136594  normal  0.0522815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1157  Mg chelatase, subunit ChlI  51.53 
 
 
530 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216513  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1549  Mg chelatase, subunit ChlI  55.73 
 
 
515 aa  429  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222105 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1408  Mg chelatase, subunit ChlI  52.54 
 
 
517 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1319  Mg chelatase, subunit ChlI  50.6 
 
 
506 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1176  Mg chelatase, subunit ChlI  51.86 
 
 
509 aa  425  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3122  Mg chelatase, subunit ChlI  54.65 
 
 
506 aa  420  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00256613  normal  0.153243 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23660  Mg chelatase-related protein  51.37 
 
 
512 aa  420  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161437  normal  0.0784396 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0677  putative ATP-dependent serine protease  44.14 
 
 
511 aa  419  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147039  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0638  Mg chelatase-like protein  40.07 
 
 
547 aa  415  9.999999999999999e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.462995 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0991  Mg chelatase, subunit ChlI  55.04 
 
 
518 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.655571  normal  0.0802867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2192  Mg chelatase subunit ChlI  50.98 
 
 
510 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.81013  normal  0.95004 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  49.8 
 
 
517 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142573  decreased coverage  0.00119551 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10080  Mg chelatase-related protein  50.78 
 
 
514 aa  401  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121458  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2473  Mg chelatase, subunit ChlI  48.92 
 
 
514 aa  402  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0320382  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  45.47 
 
 
504 aa  398  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  45.54 
 
 
520 aa  395  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  41.5 
 
 
510 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  43.42 
 
 
509 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  44.05 
 
 
509 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  43.42 
 
 
509 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  41.02 
 
 
516 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  43.03 
 
 
509 aa  385  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3247  Mg chelatase, subunit ChlI  46.03 
 
 
528 aa  383  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433317  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11150  Mg chelatase-related protein  51.08 
 
 
511 aa  380  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.038106  normal  0.404293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  42.24 
 
 
509 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  42.75 
 
 
509 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  47.21 
 
 
499 aa  382  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  42.94 
 
 
509 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  45.74 
 
 
512 aa  378  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  41.67 
 
 
507 aa  372  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  39.73 
 
 
513 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  44.69 
 
 
505 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  48.51 
 
 
504 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  41.6 
 
 
513 aa  370  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09250  Mg chelatase-related protein  47.57 
 
 
534 aa  369  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.148651  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  47.15 
 
 
513 aa  372  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  38.66 
 
 
509 aa  372  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  41.78 
 
 
506 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  39.02 
 
 
512 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  38.82 
 
 
512 aa  367  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  40.91 
 
 
506 aa  366  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  39.44 
 
 
508 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  42.26 
 
 
509 aa  363  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  41.04 
 
 
508 aa  363  6e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  41.68 
 
 
506 aa  362  1e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  45.26 
 
 
501 aa  360  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  38.81 
 
 
511 aa  360  3e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  38.81 
 
 
512 aa  360  5e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  39.65 
 
 
513 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  46.43 
 
 
514 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  40.4 
 
 
514 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  38.1 
 
 
512 aa  356  5.999999999999999e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  40.2 
 
 
513 aa  355  7.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  36.56 
 
 
512 aa  355  7.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  39.84 
 
 
509 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1135  Mg chelatase, subunit ChlI  43.42 
 
 
505 aa  353  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00125802  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  45.76 
 
 
506 aa  353  4e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  45.87 
 
 
497 aa  353  5e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0159  Mg chelatase, subunit ChlI  42.29 
 
 
511 aa  352  7e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00157888  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  39.25 
 
 
512 aa  351  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3748  Mg chelatase, subunit ChlI  43.54 
 
 
505 aa  349  5e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.224013  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  37.18 
 
 
507 aa  349  5e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0452  Mg chelatase-related protein  45.04 
 
 
500 aa  349  8e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789016  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  42.21 
 
 
511 aa  348  9e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  46.12 
 
 
497 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3777  Mg chelatase, subunit ChlI  42.77 
 
 
508 aa  348  2e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  39.92 
 
 
510 aa  345  8e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  43.9 
 
 
497 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4016  putative ATP-dependent protease  41.08 
 
 
506 aa  343  2.9999999999999997e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0359252 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  37.77 
 
 
510 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4762  Mg chelatase, subunit ChlI  44.16 
 
 
507 aa  343  2.9999999999999997e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4110  putative ATP-dependent protease  42.43 
 
 
506 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  40.16 
 
 
508 aa  342  1e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4290  putative ATP-dependent protease  42.23 
 
 
506 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4125  putative ATP-dependent protease  42.43 
 
 
506 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  38.72 
 
 
516 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0331  competence-related protein  41.42 
 
 
509 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  42.18 
 
 
505 aa  340  4e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1445  Mg chelatase-related protein  40.24 
 
 
511 aa  340  4e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4033  Mg chelatase, subunit ChlI  42.97 
 
 
508 aa  340  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2487  ComM-related protein  43.71 
 
 
507 aa  339  5.9999999999999996e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4231  putative ATP-dependent protease  42.03 
 
 
506 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4182  putative ATP-dependent protease  42.23 
 
 
506 aa  339  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4133  putative ATP-dependent protease  41.68 
 
 
506 aa  339  8e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.815544  normal  0.463834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>