149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0570 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0570  ATP-dependent citrate lyase beta subunit  100 
 
 
444 aa  900    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1056  ATP citrate synthase, subunit 1  56.66 
 
 
435 aa  506  9.999999999999999e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00742266  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54477  atp-citrate synthase  42.25 
 
 
1082 aa  323  3e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02435  citrate lyase subunit (Eurofung)  38.18 
 
 
485 aa  300  3e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.031235  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00800  conserved hypothetical protein  38.81 
 
 
1149 aa  296  4e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0796  citrate lyase, subunit 1  31.55 
 
 
398 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.620183  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1061  citrate lyase, subunit 1  31.79 
 
 
398 aa  151  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1089  ATP-grasp domain protein  32.79 
 
 
399 aa  150  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.520899  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1392  ATP-grasp domain protein  31.09 
 
 
398 aa  150  5e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.254868  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1232  ATP-grasp domain protein  30.88 
 
 
398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1307  ATP citrate lyase subunit 1  29.7 
 
 
398 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.810397  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1350  ATP-grasp domain protein  31.16 
 
 
398 aa  141  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0925  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.7 
 
 
382 aa  65.5  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  26.7 
 
 
386 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  25.58 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  26.7 
 
 
386 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3639  ATP-grasp domain-containing protein  22.38 
 
 
424 aa  62  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00395408  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  26.23 
 
 
386 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  26.23 
 
 
386 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  26.23 
 
 
386 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  26.23 
 
 
386 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  26.23 
 
 
386 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  26.23 
 
 
386 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2763  ATP-grasp domain protein  21.78 
 
 
431 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4569  succinyl-CoA synthetase subunit beta  27.8 
 
 
378 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0102197  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3392  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.93 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2240  succinyl-CoA synthetase subunit beta  26.7 
 
 
403 aa  59.7  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4047  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.93 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.84 
 
 
379 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5147  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  25.33 
 
 
390 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.710728  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1889  succinyl-CoA synthetase subunit beta  27.34 
 
 
387 aa  55.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4684  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.09 
 
 
386 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.29 
 
 
386 aa  56.6  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  26.12 
 
 
386 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  26.58 
 
 
389 aa  56.2  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  26.46 
 
 
386 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0495  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  25.42 
 
 
386 aa  55.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000993882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2699  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  25.42 
 
 
386 aa  55.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0793427 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6014  ATP-grasp domain-containing protein  22.74 
 
 
432 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.29 
 
 
391 aa  55.1  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3930  succinyl-CoA synthetase subunit beta  24.83 
 
 
379 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0469  succinyl-CoA synthetase subunit beta  24.92 
 
 
388 aa  54.3  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0458  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.25 
 
 
388 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.539778  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0869  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.66 
 
 
386 aa  53.9  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1267  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  25.19 
 
 
423 aa  53.9  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6602  succinyl-CoA synthetase subunit beta  28.47 
 
 
404 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.459715 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0597  succinyl-CoA synthetase subunit beta  24.73 
 
 
390 aa  53.5  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4682  succinyl-CoA synthetase subunit beta  24.49 
 
 
386 aa  53.1  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21216  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0474  succinyl-CoA synthetase subunit beta  24.92 
 
 
388 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0397  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  25.86 
 
 
417 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.254112  normal  0.0232854 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2038  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.33 
 
 
388 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2649  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.33 
 
 
388 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0430  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  25 
 
 
362 aa  52.8  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.147024  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1557  succinyl-CoA synthetase subunit beta  24.82 
 
 
390 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2678  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.33 
 
 
388 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.406945  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0275  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.26 
 
 
388 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0975  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.26 
 
 
388 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0646  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.26 
 
 
388 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.017874  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2696  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.33 
 
 
388 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2675  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.26 
 
 
388 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2401  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.26 
 
 
388 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.26 
 
 
388 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0817  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.26 
 
 
388 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0014  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.26 
 
 
388 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0357  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  25.2 
 
 
362 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0021079 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3292  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.69 
 
 
389 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251012  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2570  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.33 
 
 
388 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.08 
 
 
388 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0530  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.25 
 
 
389 aa  51.6  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00340695  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3945  succinyl-CoA synthetase subunit beta  23.57 
 
 
388 aa  51.6  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385374  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0674  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.69 
 
 
389 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0911  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.5 
 
 
385 aa  51.6  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.793217  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0981  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  24.83 
 
 
405 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23259  normal  0.387246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2736  succinyl-CoA synthetase subunit beta  24.01 
 
 
407 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.217876  normal  0.563324 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0554  succinyl-CoA synthetase subunit beta  24.92 
 
 
388 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3018  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.84 
 
 
396 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.632407  hitchhiker  0.0091052 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1087  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  25.27 
 
 
391 aa  50.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000260623  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0919  succinyl-CoA synthetase subunit beta  26.03 
 
 
386 aa  50.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3998  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.06 
 
 
387 aa  50.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0030268  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1694  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  26.61 
 
 
395 aa  50.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08536  Succinyl-CoA synthetase, beta subunit  25.16 
 
 
397 aa  50.1  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5976  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.67 
 
 
388 aa  50.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5192  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  26.19 
 
 
388 aa  50.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  26.11 
 
 
386 aa  50.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0479  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  25.13 
 
 
362 aa  50.1  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0154  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  24.37 
 
 
400 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306338  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1996  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  25.61 
 
 
398 aa  48.9  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4359  succinyl-CoA synthetase subunit beta  27.27 
 
 
403 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29740  Succinyl-CoA synthetase, beta subunit  24.13 
 
 
389 aa  48.5  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0305  ATP citrate lyase subunit 1  22.04 
 
 
423 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3396  succinyl-CoA synthetase subunit beta  28.42 
 
 
397 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  24.88 
 
 
388 aa  48.5  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2730  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  24.66 
 
 
388 aa  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3257  malate--CoA ligase subunit beta  23.08 
 
 
389 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  26.4 
 
 
388 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  26.4 
 
 
388 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0490  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  26.69 
 
 
410 aa  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0653  succinyl-CoA synthetase subunit beta  24.67 
 
 
388 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1547  succinyl-CoA synthetase subunit beta  23.65 
 
 
389 aa  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00163339  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1730  succinyl-CoA synthetase subunit beta  23.96 
 
 
397 aa  48.5  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>