More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4447 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4447  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
253 aa  490  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.175913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4961  enoyl-CoA hydratase  90.08 
 
 
253 aa  424  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.313807  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32890  enoyl-CoA hydratase  67.47 
 
 
258 aa  333  2e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0620133  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0289  enoyl-CoA hydratase  69.76 
 
 
257 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0727939  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10689  enoyl-CoA hydratase  70.68 
 
 
263 aa  313  9.999999999999999e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3941  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  69.76 
 
 
255 aa  312  3.9999999999999997e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  66.53 
 
 
260 aa  311  7.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1272  enoyl-CoA hydratase  66.67 
 
 
265 aa  310  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0499602  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1006  enoyl-CoA hydratase  71.17 
 
 
254 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.451958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0978  enoyl-CoA hydratase  71.17 
 
 
254 aa  308  5e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0996  enoyl-CoA hydratase  71.17 
 
 
254 aa  308  5e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5084  enoyl-CoA hydratase  67.33 
 
 
252 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.965441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0473  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  65.74 
 
 
264 aa  293  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1403  enoyl-CoA hydratase  59.85 
 
 
267 aa  293  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.930333  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2337  enoyl-CoA hydratase  72.61 
 
 
258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.072463  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0288  enoyl-CoA hydratase  70.75 
 
 
255 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.977294  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01778  enoyl-CoA hydratase  65.16 
 
 
259 aa  281  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6226  enoyl-CoA hydratase  65.85 
 
 
248 aa  276  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4725  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.36 
 
 
254 aa  274  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0948054  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0151  enoyl-CoA hydratase  57.31 
 
 
260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0701  enoyl-CoA hydratase  57.71 
 
 
261 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19740  enoyl-CoA hydratase  60.47 
 
 
256 aa  269  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1700  enoyl-CoA hydratase  60.47 
 
 
256 aa  268  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183828  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0387  enoyl-CoA hydratase  55.91 
 
 
266 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0344  enoyl-CoA hydratase  60.47 
 
 
267 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1456  enoyl-CoA hydratase  60.47 
 
 
257 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423076  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3276  enoyl-CoA hydratase  64.75 
 
 
245 aa  256  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1778  enoyl-CoA hydratase  60.16 
 
 
259 aa  255  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0941  enoyl-CoA hydratase  56.18 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6186  enoyl-CoA hydratase  63.78 
 
 
262 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0785  enoyl-CoA hydratase  61.96 
 
 
274 aa  248  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.460617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3896  enoyl-CoA hydratase  61.81 
 
 
274 aa  241  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4465  enoyl-CoA hydratase  58.8 
 
 
252 aa  241  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0779435  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4094  enoyl-CoA hydratase  56.82 
 
 
265 aa  235  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2431  enoyl-CoA hydratase  61.22 
 
 
292 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197627  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3498  enoyl-CoA hydratase  54.14 
 
 
271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00180  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07560)  47.43 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3453  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.65 
 
 
234 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0500  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.18 
 
 
289 aa  159  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217153  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4479  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.83 
 
 
259 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.3 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.83 
 
 
269 aa  149  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  39.3 
 
 
264 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.74 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  38.39 
 
 
259 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  41.36 
 
 
260 aa  129  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.2 
 
 
797 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  42.93 
 
 
254 aa  128  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  41.15 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  41.15 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  41.15 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  41.12 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  36.77 
 
 
259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  38.83 
 
 
259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.57 
 
 
269 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.61 
 
 
259 aa  124  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  38.27 
 
 
253 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  41.94 
 
 
257 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  37.19 
 
 
253 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.78 
 
 
267 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  38.05 
 
 
259 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  34.03 
 
 
263 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.08 
 
 
273 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4318  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.11 
 
 
250 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  45.88 
 
 
254 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  34.48 
 
 
266 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  41.94 
 
 
254 aa  122  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.05 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  34.33 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  34.33 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  34.33 
 
 
269 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0222  enoyl-CoA hydratase  37.08 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.75 
 
 
659 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.43 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  39.55 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  40.87 
 
 
257 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10224  enoyl-CoA hydratase  42.78 
 
 
262 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.91 
 
 
259 aa  119  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1675  enoyl-CoA hydratase  43.1 
 
 
259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  39.47 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.67 
 
 
249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  39.04 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.94 
 
 
261 aa  118  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.71 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  38.16 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  38.03 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
266 aa  116  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  36.53 
 
 
261 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  37.72 
 
 
261 aa  116  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  34.47 
 
 
266 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  36.53 
 
 
261 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  36.53 
 
 
261 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  36.53 
 
 
261 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  36.53 
 
 
261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  40.38 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  39.64 
 
 
255 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  36.84 
 
 
261 aa  115  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>