More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3951 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3951  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  100 
 
 		 574 aa  1155    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3294  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32 
 
 		 609 aa  306  9.000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6335  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  33.28 
 
 		 582 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  31.5 
 
 		 587 aa  257  4e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  31.55 
 
 		 587 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  30.89 
 
 		 587 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  29.82 
 
 		 599 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  30.48 
 
 		 587 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1114  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.27 
 
 		 562 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0428  acetolactate synthase  30.32 
 
 		 583 aa  228  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.78 
 
 		 554 aa  225  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2652  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.05 
 
 		 586 aa  220  6e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.32 
 
 		 563 aa  217  5e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.04 
 
 		 569 aa  216  9e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  29.4 
 
 		 566 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.35 
 
 		 559 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  29.35 
 
 		 550 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  27.74 
 
 		 552 aa  213  7e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0639  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.93 
 
 		 593 aa  213  7.999999999999999e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0915985  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.13 
 
 		 552 aa  211  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.34 
 
 		 572 aa  211  4e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.18 
 
 		 566 aa  210  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.44 
 
 		 588 aa  208  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0186  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.95 
 
 		 576 aa  208  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0051  acetolactate synthase  26.57 
 
 		 547 aa  207  4e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0630  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  30.65 
 
 		 591 aa  207  4e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123449  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.91 
 
 		 535 aa  207  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.32 
 
 		 574 aa  207  6e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  28.77 
 
 		 562 aa  206  7e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.64 
 
 		 552 aa  206  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4168  acetolactate synthase  28.01 
 
 		 550 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4208  acetolactate synthase  28.01 
 
 		 550 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.07 
 
 		 563 aa  206  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.79 
 
 		 566 aa  206  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4857  thiamine pyrophosphate protein  30.67 
 
 		 603 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  28.44 
 
 		 567 aa  205  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.76 
 
 		 566 aa  204  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0790  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.01 
 
 		 564 aa  204  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000243733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.03 
 
 		 582 aa  203  6e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.75 
 
 		 554 aa  203  8e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3533  acetolactate synthase  27.4 
 
 		 547 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.476222 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.56 
 
 		 557 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.14 
 
 		 565 aa  201  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.09 
 
 		 612 aa  201  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0017  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.17 
 
 		 599 aa  201  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.65 
 
 		 566 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1928  acetolactate synthase  27.44 
 
 		 545 aa  200  6e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886275  normal  0.0286883 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  26.87 
 
 		 555 aa  200  7e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2059  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.67 
 
 		 573 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0639  acetolactate synthase  26.9 
 
 		 548 aa  199  9e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237163  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.32 
 
 		 559 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0228  acetolactate synthase  26.13 
 
 		 550 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.027454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.5 
 
 		 558 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2560  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.12 
 
 		 573 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000271615  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.19 
 
 		 566 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1043  acetolactate synthase  28.78 
 
 		 583 aa  199  2.0000000000000003e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2037  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.91 
 
 		 564 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182642  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.51 
 
 		 574 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2168  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.4 
 
 		 573 aa  197  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.71 
 
 		 573 aa  197  6e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3793  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.72 
 
 		 572 aa  197  6e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.99 
 
 		 581 aa  196  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2821  acetolactate synthase large subunit  26.65 
 
 		 581 aa  196  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3674  acetolactate synthase  26.36 
 
 		 546 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.839187 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  29.29 
 
 		 589 aa  196  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001649  acetolactate synthase large subunit  27.87 
 
 		 574 aa  196  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546971  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.5 
 
 		 572 aa  196  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0634  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.88 
 
 		 573 aa  195  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0951931  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  27.66 
 
 		 566 aa  195  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.06 
 
 		 563 aa  195  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5509  acetolactate synthase  26.06 
 
 		 546 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1650  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.12 
 
 		 617 aa  195  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.121087 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0624  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.87 
 
 		 574 aa  195  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.146468 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.58 
 
 		 581 aa  194  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.8 
 
 		 620 aa  194  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0853  acetolactate synthase, large subunit  27.49 
 
 		 573 aa  194  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.640805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1175  Acetolactate synthase  28.6 
 
 		 591 aa  194  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.112778  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3230  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.26 
 
 		 644 aa  194  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3605  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.62 
 
 		 572 aa  194  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0840  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein TPP-binding protein  26.46 
 
 		 547 aa  194  5e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.923558  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00079  acetolactate synthase III large subunit  27.99 
 
 		 574 aa  193  8e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0497  acetolactate synthase  25.88 
 
 		 546 aa  193  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00078  hypothetical protein  27.99 
 
 		 574 aa  193  8e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  27.22 
 
 		 572 aa  193  9e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.99 
 
 		 574 aa  193  9e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.630637  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.99 
 
 		 573 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302703  decreased coverage  0.000148215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.18 
 
 		 557 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0079  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.99 
 
 		 574 aa  192  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.41 
 
 		 593 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3522  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.99 
 
 		 574 aa  192  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.39 
 
 		 602 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.88 
 
 		 575 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2932  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.88 
 
 		 593 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0474  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.78 
 
 		 585 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2089  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.23 
 
 		 597 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0517417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3554  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.52 
 
 		 581 aa  192  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.743835  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.82 
 
 		 604 aa  192  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.88 
 
 		 575 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0086  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.99 
 
 		 574 aa  192  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3580  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.99 
 
 		 574 aa  192  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>