139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0513 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  87.1 
 
 
61 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  79.03 
 
 
62 aa  99  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  77.05 
 
 
62 aa  95.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  81.36 
 
 
63 aa  93.6  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  72.58 
 
 
62 aa  92  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  76.27 
 
 
63 aa  91.3  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  74.19 
 
 
62 aa  91.3  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  77.97 
 
 
63 aa  90.5  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  76.27 
 
 
63 aa  89.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  72.88 
 
 
63 aa  89  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  76.27 
 
 
63 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  74.58 
 
 
113 aa  87  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  74.58 
 
 
63 aa  86.7  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  78.57 
 
 
64 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  72.88 
 
 
63 aa  85.5  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  67.21 
 
 
62 aa  83.6  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  63.93 
 
 
64 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  66.67 
 
 
68 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  62.07 
 
 
68 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  60.66 
 
 
68 aa  74.3  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4504  hypothetical protein  68.52 
 
 
62 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4378  hypothetical protein  59.68 
 
 
62 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  61.4 
 
 
62 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4869  hypothetical protein  60 
 
 
60 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.940812 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  57.38 
 
 
73 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  57.38 
 
 
73 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  53.33 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  53.33 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4255  hypothetical protein  53.97 
 
 
69 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912797  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4685  hypothetical protein  53.97 
 
 
69 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.144765  normal  0.226614 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  57.89 
 
 
68 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  53.45 
 
 
68 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  55.36 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  58.93 
 
 
80 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  55.36 
 
 
66 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  50.82 
 
 
67 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  55.17 
 
 
69 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  55.56 
 
 
69 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  57.41 
 
 
69 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  55.93 
 
 
67 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  50 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  48.33 
 
 
75 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  55.56 
 
 
65 aa  54.3  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1471  hypothetical protein  45.31 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.394456  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  46.27 
 
 
80 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1728  hypothetical protein  55.36 
 
 
78 aa  53.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0749322  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  52.38 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  54.55 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  45.76 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0441  protein of unknown function DUF397  50.91 
 
 
63 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  50.91 
 
 
64 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1745  hypothetical protein  50 
 
 
64 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64493  normal  0.800474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  47.14 
 
 
76 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7003  protein of unknown function DUF397  52.83 
 
 
84 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  49.12 
 
 
67 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0485  protein of unknown function DUF397  45 
 
 
63 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  42.62 
 
 
64 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  44.26 
 
 
73 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  54.9 
 
 
67 aa  50.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  58 
 
 
79 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0487  protein of unknown function DUF397  40 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  49.09 
 
 
72 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  48.33 
 
 
75 aa  50.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  46.67 
 
 
61 aa  50.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  56 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  48.33 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1834  protein of unknown function DUF397  51.92 
 
 
59 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  58.7 
 
 
57 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  44.64 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3777  protein of unknown function DUF397  45.61 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3778  protein of unknown function DUF397  48.21 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3649  protein of unknown function DUF397  52.83 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5628  hypothetical protein  48.21 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  48.21 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  54 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4454  protein of unknown function DUF397  44.26 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3779  protein of unknown function DUF397  41.94 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  47.46 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  44.83 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  45.45 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3780  protein of unknown function DUF397  43.33 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2266  hypothetical protein  51.72 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0142951  hitchhiker  0.00561226 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4781  protein of unknown function DUF397  43.1 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4569  hypothetical protein  47.62 
 
 
77 aa  47.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5086  hypothetical protein  50 
 
 
77 aa  47.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000003971 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0486  protein of unknown function DUF397  42.86 
 
 
63 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  43.24 
 
 
81 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1943  protein of unknown function DUF397  45.9 
 
 
63 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00825556  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3445  hypothetical protein  46.67 
 
 
78 aa  47  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0876  protein of unknown function DUF397  42.37 
 
 
80 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  50 
 
 
62 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1295  hypothetical protein  46.67 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471559  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4515  protein of unknown function DUF397  47.17 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  45.76 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  46.3 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  47.37 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  46.15 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  48.15 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>