More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1464 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1464  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  100 
 
 
291 aa  559  1e-158  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.879839  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0850  Sec-independent periplasmic protein translocase  55.33 
 
 
289 aa  325  8.000000000000001e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0556055  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0795  Sec-independent protein translocase TatC  53.68 
 
 
275 aa  299  3e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.166427  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0725  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  47.12 
 
 
269 aa  246  4.9999999999999997e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000256296 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0774  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.77 
 
 
263 aa  117  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0166935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.03 
 
 
262 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1965  Sec-independent protein translocase TatC  30.15 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1648  Sec-independent protein translocase TatC subunit  28.93 
 
 
250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.889374  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  29.93 
 
 
266 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.66 
 
 
259 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1268  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.11 
 
 
250 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  29.37 
 
 
266 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  28.47 
 
 
264 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3547  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.77 
 
 
259 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146328  hitchhiker  0.0021948 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0411  Sec-independent protein translocase TatC  31.05 
 
 
259 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.856028  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.31 
 
 
263 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  29.02 
 
 
267 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0417  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.64 
 
 
262 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2669  Sec-independent protein translocase TatC  30.64 
 
 
262 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.64 
 
 
262 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.434493  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.57 
 
 
260 aa  106  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  28.67 
 
 
267 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0341  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.79 
 
 
260 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0370444  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3536  Sec-independent protein translocase TatC  30.64 
 
 
262 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.71 
 
 
262 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.71 
 
 
262 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  26.18 
 
 
251 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2980  Sec-independent protein translocase TatC  29.79 
 
 
260 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0365  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.21 
 
 
261 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.494968 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0356  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.21 
 
 
261 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  26.69 
 
 
258 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.69 
 
 
258 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  26.69 
 
 
258 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  26.69 
 
 
258 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  26.69 
 
 
258 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  26.69 
 
 
258 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  26.69 
 
 
258 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  26.69 
 
 
258 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  26.69 
 
 
258 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.05 
 
 
253 aa  103  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0663  Sec-independent protein secretion pathway component TatC  28.7 
 
 
247 aa  102  8e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3680  Sec-independent protein translocase TatC  28.94 
 
 
260 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.607008  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1801  Sec-independent protein translocase TatC  28.94 
 
 
260 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2701  Sec-independent protein translocase TatC  28.94 
 
 
260 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3711  Sec-independent protein translocase TatC  28.94 
 
 
260 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  26.16 
 
 
249 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2752  Sec-independent protein translocase TatC  28.94 
 
 
260 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  30.04 
 
 
244 aa  101  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3653  Sec-independent protein translocase TatC  28.94 
 
 
260 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3252  Sec-independent protein translocase TatC  28.94 
 
 
260 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  26.07 
 
 
259 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0533  Sec-independent protein translocase TatC  33.47 
 
 
276 aa  100  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  26.07 
 
 
259 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0843  Sec-independent protein translocase TatC  29.12 
 
 
262 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.293811  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  26.07 
 
 
259 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  26.07 
 
 
259 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  26.07 
 
 
259 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  28.36 
 
 
251 aa  100  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3235  Sec-independent protein translocase TatC  28.26 
 
 
260 aa  99.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  26.62 
 
 
249 aa  99.4  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3955  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  25.45 
 
 
256 aa  99.4  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.2 
 
 
264 aa  99.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1907  Sec-independent protein translocase TatC  27.46 
 
 
271 aa  99.4  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.16 
 
 
254 aa  99.4  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4405  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.92 
 
 
269 aa  99  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.632551  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.62 
 
 
259 aa  98.6  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0253  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  26.64 
 
 
256 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  28.79 
 
 
241 aa  98.2  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2762  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.95 
 
 
266 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0340743  normal  0.092649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0699  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.93 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4242  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  26.92 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0063  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.24 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0346056  normal  0.0538922 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  24.82 
 
 
249 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3900  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  24.45 
 
 
251 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0426  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  24.45 
 
 
251 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000454537 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  26.41 
 
 
250 aa  96.7  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  24.45 
 
 
251 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.289196 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  24.55 
 
 
249 aa  96.7  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0414  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  24.45 
 
 
251 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3592  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  24.41 
 
 
266 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0318  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.17 
 
 
258 aa  96.3  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0165  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  26.53 
 
 
255 aa  96.3  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  29.5 
 
 
247 aa  96.3  6e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0501  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  24.19 
 
 
249 aa  95.9  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  28.99 
 
 
269 aa  95.9  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2185  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.88 
 
 
264 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2322  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25 
 
 
277 aa  95.5  9e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0472235  normal  0.432389 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  27.11 
 
 
250 aa  95.5  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2002  Sec-independent protein translocase TatC  28.18 
 
 
278 aa  95.1  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.4915  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  26.83 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.29 
 
 
255 aa  95.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30 
 
 
253 aa  95.1  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0547  Sec-independent protein translocase TatC  27.92 
 
 
245 aa  94.7  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0576043  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.83 
 
 
262 aa  95.5  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001922  twin-arginine translocation protein TatC  27.98 
 
 
250 aa  94.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45480  twin arginine-targeting protein translocase  25.55 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1468  Sec-independent protein translocase TatC  33.05 
 
 
368 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0443024  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  33.16 
 
 
266 aa  94.7  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1096  Sec-independent protein translocase TatC  31.79 
 
 
279 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3928  Sec-independent protein translocase TatC  31.79 
 
 
255 aa  94  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>