41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3042 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3042  CheW protein  100 
 
 		 377 aa  763    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1642  CheW protein  58.09 
 
 		 338 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.991032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1390  CheW protein  52.7 
 
 		 329 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.180967 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2273  CheW domain-containing protein  46.56 
 
 		 359 aa  326  3e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.607284  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2552  putative CheW protein  48.42 
 
 		 330 aa  322  6e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2902  putative CheW protein  49.61 
 
 		 336 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.144526  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1306  CheW protein  48.44 
 
 		 335 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.975654 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3044  putative CheW protein  49.61 
 
 		 336 aa  318  7e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1373  CheW protein  48.16 
 
 		 335 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.171778 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2912  putative CheW protein  49.87 
 
 		 336 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.696236  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1366  CheW protein  49.35 
 
 		 335 aa  317  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898971 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1461  CheW protein  49.34 
 
 		 331 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1206  CheW protein  45.02 
 
 		 360 aa  316  4e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.750839  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3203  CheW domain-containing protein  49.21 
 
 		 326 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1350  CheW-like protein  57.04 
 
 		 343 aa  296  4e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1385  CheW protein  42.15 
 
 		 305 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02864  CheW protein  57.24 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1527  cheW-like domain-containing protein  47.12 
 
 		 238 aa  201  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54686  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2284  cheW-like protein  50.3 
 
 		 363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03138  hypothetical protein  42.86 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1648  hypothetical protein  54.23 
 
 		 338 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002838  hypothetical protein  47.87 
 
 		 359 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3024  CheW protein  47.92 
 
 		 287 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3420  CheW domain-containing protein  43.88 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1534  putative CheW protein  40.76 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.357648 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4333  CheW domain-containing protein  40.76 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1967  CheW domain-containing protein  43.23 
 
 		 260 aa  134  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3902  CheW protein  43.97 
 
 		 296 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3659  CheW protein  43.26 
 
 		 291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1571  CheW protein  41.4 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.99203  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2797  putative CheW protein  41.67 
 
 		 265 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.198495  normal  0.208066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45510  CheW domain-containing protein  43.26 
 
 		 296 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3863  hypothetical protein  43.26 
 
 		 296 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.715886  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2156  flagellar hook-basal body complex protein FliE  30.71 
 
 		 385 aa  126  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3429  CheW-like protein  37.2 
 
 		 300 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1987  CheW domain protein  41.13 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.998121  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1346  CheW protein  43.66 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.22411  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0991  CheW protein  36.17 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0500652  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0471  putative CheW protein  35.37 
 
 		 316 aa  101  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.404706  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1183  CheW domain protein  31.97 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.14971 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0723  hypothetical protein  23.53 
 
 		 289 aa  47  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>