More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9167 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9167  Cysteine desulfurase  100 
 
 		 433 aa  856    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3439  cysteine desulfurase  79.81 
 
 		 457 aa  607  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0847  aminotransferase class V  58.88 
 
 		 449 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5748  aminotransferase class V  56.97 
 
 		 452 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380552  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5990  Cysteine desulfurase  54.91 
 
 		 467 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.122747 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0546  Cysteine desulfurase  55.88 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0783  Cysteine desulfurase  53.4 
 
 		 484 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0275  aminotransferase, class V  58.53 
 
 		 414 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252691 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0318  cysteine desulfurase  57.69 
 
 		 414 aa  365  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159519  hitchhiker  0.000213792 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2942  Cysteine desulfurase  51.7 
 
 		 480 aa  360  3e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2389  Cysteine desulfurase  48.82 
 
 		 472 aa  355  1e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000376862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4922  cysteine desulfurase  49.66 
 
 		 518 aa  343  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2656  cysteine desulfurase  47.21 
 
 		 470 aa  340  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35010  selenocysteine lyase  52.93 
 
 		 482 aa  338  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3438  cysteine desulfurase  53.4 
 
 		 445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0508  Cysteine desulfurase  51.01 
 
 		 487 aa  332  6e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0935  aminotransferase class V  49.88 
 
 		 448 aa  331  1e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239367  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3118  Cysteine desulfurase  50.34 
 
 		 476 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2391  Cysteine desulfurase  50.61 
 
 		 478 aa  320  3e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.855835 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0273  aminotransferase class V  49.88 
 
 		 439 aa  319  5e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0811  Cysteine desulfurase  38.3 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20010  Cysteine desulfurase  35 
 
 		 442 aa  252  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000584034  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1720  aminotransferase, class V  34.05 
 
 		 428 aa  244  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116446  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1448  aminotransferase, class V  34.29 
 
 		 428 aa  244  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2429  cysteine desulfurase  37.32 
 
 		 470 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2844  cysteine desulfurase  36.14 
 
 		 460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0201  aminotransferase, class V  33.41 
 
 		 485 aa  224  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.73 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.27 
 
 		 414 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.17 
 
 		 409 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.46 
 
 		 414 aa  209  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.84 
 
 		 415 aa  209  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  36.73 
 
 		 878 aa  207  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.15 
 
 		 412 aa  206  5e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  34.49 
 
 		 408 aa  205  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.46 
 
 		 414 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.79 
 
 		 415 aa  203  4e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  36.99 
 
 		 394 aa  203  5e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.97 
 
 		 417 aa  202  9e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.83 
 
 		 413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.83 
 
 		 413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.32 
 
 		 408 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.37 
 
 		 406 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.32 
 
 		 412 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  34.81 
 
 		 410 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.71 
 
 		 415 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.34 
 
 		 657 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.34 
 
 		 662 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.18 
 
 		 413 aa  196  6e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  35.52 
 
 		 406 aa  196  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  36.34 
 
 		 661 aa  196  6e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.84 
 
 		 414 aa  196  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  35.35 
 
 		 406 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  34.85 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.35 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.85 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  34.85 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  35.68 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  35.1 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.96 
 
 		 650 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  35.23 
 
 		 666 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  37.59 
 
 		 880 aa  194  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.86 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.47 
 
 		 435 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  34.24 
 
 		 413 aa  194  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.84 
 
 		 418 aa  194  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.41 
 
 		 404 aa  194  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.59 
 
 		 418 aa  194  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.6 
 
 		 406 aa  194  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.83 
 
 		 426 aa  194  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  37.01 
 
 		 404 aa  193  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  35.08 
 
 		 394 aa  193  5e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.69 
 
 		 666 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5203  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.7 
 
 		 941 aa  192  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  34.06 
 
 		 422 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.88 
 
 		 444 aa  192  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  31.41 
 
 		 425 aa  192  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  35.57 
 
 		 879 aa  192  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.61 
 
 		 425 aa  192  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.63 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  35.1 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  36.48 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.52 
 
 		 678 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  35.19 
 
 		 407 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.7 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  35.32 
 
 		 404 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2039  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.87 
 
 		 610 aa  190  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.51 
 
 		 404 aa  190  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  36.74 
 
 		 414 aa  190  5e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  31.58 
 
 		 414 aa  190  5e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.94 
 
 		 407 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.11 
 
 		 419 aa  189  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.59 
 
 		 406 aa  189  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.08 
 
 		 413 aa  189  9e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  34.77 
 
 		 604 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.25 
 
 		 429 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_002620  TC0059  aminotransferase, class V  33.5 
 
 		 400 aa  188  2e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.768398  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  34.77 
 
 		 604 aa  188  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.82 
 
 		 413 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.67 
 
 		 560 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.305949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>