96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9033 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9033  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  367  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1635  YceI family protein  56.67 
 
 		 186 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.163247 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0292  YceI family protein  36.75 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2592  hypothetical protein  38.18 
 
 		 178 aa  95.1  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11918  hypothetical protein  32.16 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5164  hypothetical protein  34.5 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1166  hypothetical protein  34.88 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0090  YceI family protein  29.48 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0432  YceI family protein  33.33 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.115751  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  30.89 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  32.39 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0433  YceI family protein  33.9 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0486569  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  41 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  28.89 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  28.26 
 
 		 242 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  33.33 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  26.74 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  33 
 
 		 183 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  26.74 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  28.06 
 
 		 219 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  32 
 
 		 183 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4329  YceI family protein  28.92 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.969804  normal  0.149474 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  32.5 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  26.74 
 
 		 180 aa  51.2  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  32.03 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  34.72 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  25.13 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  28.18 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  31.17 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  27.6 
 
 		 187 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  32 
 
 		 183 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  30.77 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  29.17 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  27.69 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  27.18 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  29.36 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  31 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  30.49 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  28.36 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  36.08 
 
 		 182 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  24.64 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  29.59 
 
 		 192 aa  45.1  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  27.27 
 
 		 202 aa  44.7  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  31.31 
 
 		 192 aa  44.7  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  28.97 
 
 		 191 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  31.31 
 
 		 192 aa  44.7  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  31.31 
 
 		 192 aa  44.7  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  28.47 
 
 		 191 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  26.92 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  30.16 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  32.65 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  25.19 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7583  YceI-like family protein  39.74 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.94246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0518  YceI family protein  32.19 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000120674  hitchhiker  0.000476131 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  33.66 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  33.66 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  29.41 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  30 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  28.72 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  29.82 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  42.86 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  31.17 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  27.86 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  34.41 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  25.98 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  29.59 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  29.81 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  31.97 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  29.81 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  33.9 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  28.43 
 
 		 214 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  39.66 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  40.48 
 
 		 182 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  25.21 
 
 		 175 aa  42  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  40.48 
 
 		 182 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  40.48 
 
 		 182 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  31.15 
 
 		 223 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2435  YceI family protein  32.89 
 
 		 188 aa  42  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.832405  normal  0.0582212 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  32.18 
 
 		 237 aa  41.6  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  30.11 
 
 		 200 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  31.47 
 
 		 186 aa  41.6  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  32.18 
 
 		 237 aa  41.2  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  27.55 
 
 		 191 aa  41.6  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  27.55 
 
 		 191 aa  41.6  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  31.15 
 
 		 201 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  27.55 
 
 		 191 aa  41.6  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  27.55 
 
 		 191 aa  41.6  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  32.35 
 
 		 192 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  27.55 
 
 		 191 aa  41.6  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  27.55 
 
 		 191 aa  41.6  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  32.35 
 
 		 192 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  27.55 
 
 		 191 aa  41.6  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  27.55 
 
 		 191 aa  41.6  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5358  YceI family protein  37.5 
 
 		 185 aa  41.2  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  26.67 
 
 		 189 aa  41.2  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  25 
 
 		 199 aa  41.2  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>