38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8049 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8050  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  58.68 
 
 		 852 aa  748    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8049  hypothetical protein  100 
 
 		 891 aa  1697    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3549  protein of unknown function DUF214  37.83 
 
 		 881 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4158  protein of unknown function DUF214  30.49 
 
 		 934 aa  213  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.434869  normal  0.0912085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1413  hypothetical protein  34.99 
 
 		 926 aa  200  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.232958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3175  protein of unknown function DUF214  31.36 
 
 		 910 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.612521  normal  0.0435773 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0699  protein of unknown function DUF214  31.52 
 
 		 934 aa  179  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4811  protein of unknown function DUF214  33.81 
 
 		 998 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.661642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0830  protein of unknown function DUF214  32.47 
 
 		 958 aa  86.7  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.800045 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  23.37 
 
 		 858 aa  63.9  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  27.61 
 
 		 855 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  23.51 
 
 		 857 aa  62.4  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  28.11 
 
 		 841 aa  60.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  29.61 
 
 		 930 aa  60.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06210  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  27.29 
 
 		 933 aa  59.7  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  39.17 
 
 		 849 aa  56.6  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  18.99 
 
 		 856 aa  56.6  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  38.33 
 
 		 849 aa  54.7  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  32.14 
 
 		 843 aa  53.5  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 871 aa  52.8  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  26.82 
 
 		 854 aa  52  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  38.4 
 
 		 853 aa  51.6  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  33.61 
 
 		 859 aa  51.2  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  36.3 
 
 		 848 aa  51.6  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  29.3 
 
 		 842 aa  51.2  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  30.13 
 
 		 419 aa  51.2  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  28.65 
 
 		 880 aa  49.7  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.35 
 
 		 835 aa  47.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  29.74 
 
 		 866 aa  47  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  28.06 
 
 		 838 aa  47.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  32.28 
 
 		 836 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  29.92 
 
 		 847 aa  45.4  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  27.33 
 
 		 838 aa  45.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  27.64 
 
 		 846 aa  45.4  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  27.93 
 
 		 852 aa  45.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  30.77 
 
 		 846 aa  44.7  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  27.72 
 
 		 423 aa  44.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  30.56 
 
 		 861 aa  44.3  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>