70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4862 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4862  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  777    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0602113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8803  hypothetical protein  51.59 
 
 		 391 aa  337  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7209  hypothetical protein  47.34 
 
 		 373 aa  286  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1883  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  44.44 
 
 		 393 aa  256  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5047  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  41.06 
 
 		 370 aa  249  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1945  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  44.41 
 
 		 373 aa  244  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2596  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  39.83 
 
 		 426 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.073568  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4221  hypothetical protein  38.42 
 
 		 407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  hitchhiker  0.00109479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3253  hypothetical protein  37.53 
 
 		 424 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  30.75 
 
 		 456 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4255  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  31.31 
 
 		 443 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.4814 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  30.57 
 
 		 456 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1449  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32.45 
 
 		 436 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4877  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  34.64 
 
 		 396 aa  146  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6054  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32.14 
 
 		 425 aa  143  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2227  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  30 
 
 		 488 aa  139  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  34.05 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1038  hypothetical protein  29.27 
 
 		 468 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.059236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0950  hypothetical protein  29.54 
 
 		 468 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0893  hypothetical protein  29.54 
 
 		 468 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0869  carboxylic ester hydrolase; acetylhydrolase  29.54 
 
 		 468 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.852168  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1035  hypothetical protein  29.54 
 
 		 468 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2349399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1122  hypothetical protein  29.46 
 
 		 468 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27760  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  28.95 
 
 		 474 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0623515  normal  0.667788 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18539  predicted protein  28.42 
 
 		 713 aa  90.9  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118293  decreased coverage  0.000205789 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16690  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  26.8 
 
 		 461 aa  88.6  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.400714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1034  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.33 
 
 		 453 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.17718  decreased coverage  0.00542387 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4299  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.7 
 
 		 459 aa  72  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806064  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39860  hypothetical protein  27.85 
 
 		 546 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  31.06 
 
 		 382 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3378  hypothetical protein  28.25 
 
 		 546 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127536  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  28.63 
 
 		 464 aa  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  26.38 
 
 		 449 aa  64.7  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1158  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  26.16 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  24.9 
 
 		 449 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  27.71 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  24.37 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  25.59 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  32.58 
 
 		 433 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  31.95 
 
 		 345 aa  54.7  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  30.77 
 
 		 567 aa  53.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  28.06 
 
 		 373 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  29.02 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0848  hypothetical protein  23.89 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.722575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  27.23 
 
 		 380 aa  50.4  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  34.78 
 
 		 526 aa  50.1  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1245  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  24.74 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  29.38 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  30.77 
 
 		 568 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  31.67 
 
 		 607 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  29.13 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  29.17 
 
 		 318 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  29.17 
 
 		 318 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  32.76 
 
 		 546 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  28.39 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  28.68 
 
 		 569 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  28.33 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  25.65 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  27.01 
 
 		 568 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  24.39 
 
 		 365 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0256  hypothetical protein  25.95 
 
 		 485 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  24.42 
 
 		 352 aa  44.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  30.51 
 
 		 605 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  30.15 
 
 		 339 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3759  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.7 
 
 		 342 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.58888  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3315  lipoprotein signal peptide  34.19 
 
 		 302 aa  43.5  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  24.31 
 
 		 337 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  33.61 
 
 		 600 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  26.9 
 
 		 567 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  33.61 
 
 		 600 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>