More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4207 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  100 
 
 
508 aa  1020    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  62.27 
 
 
515 aa  614  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  52.52 
 
 
536 aa  526  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  51.04 
 
 
528 aa  504  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  37.55 
 
 
512 aa  301  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  33.58 
 
 
496 aa  265  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  37.31 
 
 
487 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  35.14 
 
 
536 aa  262  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  36.84 
 
 
486 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  33.62 
 
 
679 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  33.16 
 
 
527 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  34.15 
 
 
490 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  32.29 
 
 
510 aa  239  6.999999999999999e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  32.33 
 
 
625 aa  233  5e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  33.94 
 
 
506 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  33.21 
 
 
551 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  33.77 
 
 
505 aa  223  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  34.47 
 
 
519 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  34.78 
 
 
499 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  33.08 
 
 
569 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  34.03 
 
 
519 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  31.47 
 
 
504 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  32.95 
 
 
523 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  35.17 
 
 
502 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  35.17 
 
 
502 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  31.41 
 
 
519 aa  207  4e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  32.86 
 
 
631 aa  206  8e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  33.59 
 
 
532 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  28.93 
 
 
542 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  29.74 
 
 
547 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  31.87 
 
 
677 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  29.15 
 
 
625 aa  190  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  30.19 
 
 
647 aa  190  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  32.03 
 
 
516 aa  186  6e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  30.14 
 
 
620 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  31.28 
 
 
528 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  33.79 
 
 
492 aa  184  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  30.31 
 
 
488 aa  181  2.9999999999999997e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  30.12 
 
 
534 aa  179  8e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  30.12 
 
 
534 aa  179  9e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  31.71 
 
 
516 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  31.71 
 
 
516 aa  179  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  31.71 
 
 
516 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  31.71 
 
 
516 aa  179  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  31.71 
 
 
516 aa  179  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  31.63 
 
 
529 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  31.63 
 
 
529 aa  177  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  31.63 
 
 
529 aa  177  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  31.63 
 
 
516 aa  177  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3381  multicopper oxidase type 2  31.11 
 
 
628 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  27.88 
 
 
533 aa  172  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  31.87 
 
 
676 aa  169  8e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  30.77 
 
 
464 aa  167  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  32.37 
 
 
533 aa  166  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  28.08 
 
 
533 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  27.92 
 
 
524 aa  165  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  28.08 
 
 
533 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  32.29 
 
 
536 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  32.29 
 
 
536 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  32.99 
 
 
535 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  30.02 
 
 
708 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  28.08 
 
 
533 aa  164  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.08 
 
 
586 aa  163  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  32.57 
 
 
535 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  32.57 
 
 
535 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.08 
 
 
536 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.08 
 
 
536 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.08 
 
 
536 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.76 
 
 
579 aa  162  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.54 
 
 
591 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  25.45 
 
 
514 aa  161  3e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  30.26 
 
 
706 aa  160  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  26.39 
 
 
513 aa  160  6e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  32.36 
 
 
535 aa  160  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  29.8 
 
 
687 aa  160  7e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  27.31 
 
 
539 aa  160  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  26.69 
 
 
513 aa  159  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  27.78 
 
 
536 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  27.78 
 
 
536 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  27.51 
 
 
536 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  31.44 
 
 
532 aa  158  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  26.15 
 
 
538 aa  157  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  27.88 
 
 
536 aa  157  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  27.88 
 
 
536 aa  157  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  29.2 
 
 
499 aa  156  8e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2011  multicopper oxidase family protein  31.85 
 
 
570 aa  156  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  31.44 
 
 
531 aa  156  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  26.42 
 
 
522 aa  155  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  30.62 
 
 
698 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6341  Bilirubin oxidase  29.19 
 
 
760 aa  153  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  37.2 
 
 
643 aa  152  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  28.36 
 
 
493 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  28.36 
 
 
493 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1101  multicopper oxidase family protein  32.03 
 
 
476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0583  repressor protein for FtsI  29.07 
 
 
474 aa  146  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4257  repressor protein for FtsI  29.21 
 
 
471 aa  146  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391434 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3609  repressor protein for FtsI  29.2 
 
 
470 aa  145  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0274  repressor protein for FtsI  28.88 
 
 
474 aa  144  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3767  repressor protein for FtsI  30.43 
 
 
470 aa  144  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956133  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3308  repressor protein for FtsI  28.23 
 
 
470 aa  144  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  0.0130524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>