47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1633 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1633  glutaredoxin 2  100 
 
 		 87 aa  180  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.127795  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1608  glutaredoxin 2  76 
 
 		 79 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645835  normal  0.325879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1602  glutaredoxin 2  76.39 
 
 		 79 aa  120  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0453519  normal  0.809084 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1541  glutaredoxin 2  77.33 
 
 		 79 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1852  hypothetical protein  70 
 
 		 81 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1775  glutaredoxin 2  72.97 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36125  hitchhiker  0.000071758 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2569  glutaredoxin 2  71.62 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0621222  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2609  glutaredoxin 2  72.97 
 
 		 84 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000260144  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2684  glutaredoxin 2  72.97 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2660  glutaredoxin 2  63.38 
 
 		 78 aa  98.6  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2469  glutaredoxin 2  64.29 
 
 		 78 aa  95.5  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000139759  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2472  glutaredoxin 2  58.33 
 
 		 79 aa  90.9  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.985648  normal  0.014983 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1947  glutaredoxin 2  57.75 
 
 		 78 aa  89.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1813  glutaredoxin 2  60.27 
 
 		 78 aa  89.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2144  glutaredoxin 2  53.85 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.462224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1601  hypothetical protein  55.56 
 
 		 75 aa  87.4  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.205693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2282  glutaredoxin 2  41.89 
 
 		 77 aa  73.6  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1544  hypothetical protein  49.28 
 
 		 78 aa  71.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02336  hypothetical protein  52.86 
 
 		 83 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1552  putative glutaredoxin  47.14 
 
 		 80 aa  64.7  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240311  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1649  glutaredoxin 2  50 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.287262  normal  0.597443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3632  glutaredoxin 2  48.61 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24850  hypothetical protein  47.22 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2107  glutaredoxin 2  48.61 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1626  glutaredoxin 2  47.89 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1741  glutaredoxin 2  46.48 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  44.44 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2120  hypothetical protein  47.95 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927593  normal  0.208637 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1094  hypothetical protein  42.86 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.320355  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19000  hypothetical protein  46.48 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501632  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2498  glutaredoxin 2  43.84 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1581  glutaredoxin 2  39.44 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00969683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1777  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.59 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000908291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3966  glutaredoxin 2  42.25 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2336  hypothetical protein  45.21 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393598  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3278  hypothetical protein  36.47 
 
 		 90 aa  51.2  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3046  glutaredoxin 2  37.5 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01685  hypothetical protein  37.68 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.783759  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003439  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  48.28 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1649  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.042948 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1766  glutaredoxin 2  43.75 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1884  glutaredoxin 2  31.11 
 
 		 102 aa  42.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036544 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1088  glutaredoxin 2  38.46 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2106  hypothetical protein  38.78 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07140  Glutaredoxin-like domain (DUF836)  29.73 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.313185 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  31.17 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0363  glutaredoxin 2  41.18 
 
 		 89 aa  40  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0141098  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>