45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4385 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4385  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  233  7e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4132  transcriptional regulator, XRE family  54.95 
 
 		 113 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4238  XRE family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 113 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4297  XRE family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4189  XRE family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0994  hypothetical protein  54.95 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.679627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3975  XRE family transcriptional regulator  54.21 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0868503 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0723  transcriptional regulator, XRE family  52.83 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.474185 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1141  hypothetical protein  39.81 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.328884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0402  hypothetical protein  39.81 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.782427  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1358  helix-turn-helix domain-containing protein  37.76 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  32.67 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1024  XRE family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 93 aa  57  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1135  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5524  helix-turn-helix domain-containing protein  34.57 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.280888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1199  XRE family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441621  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0293  hypothetical protein  34.18 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000404115  normal  0.251611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0276  Cro/CI family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123998 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1226  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 93 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0745  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 93 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442536  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4335  XRE family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 93 aa  50.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3475  hypothetical protein  32.04 
 
 		 103 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0241764  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3840  hypothetical protein  41.54 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12776  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0483  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3000  putative DNA-binding protein  32.81 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.214867 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0997  putative DNA-binding protein  32.81 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1109  XRE family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 93 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814199  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0026  hypothetical protein  35.53 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000862843  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1109  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  31.25 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0935  XRE family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3970  transcriptional regulator  32.81 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1039  hypothetical protein  38.1 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0118  XRE family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3517  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4450  XRE family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1558  hypothetical protein  32.31 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101581 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2510  XRE family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.782316  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1581  hypothetical protein  29.67 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.89904  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0182  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 89 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3745  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2925  hypothetical protein  29.81 
 
 		 106 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0944333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2102  hypothetical protein  34.92 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2380  XRE family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 107 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>