More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3216 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01274  gamma-Glu-putrescine synthase  79.87 
 
 		 472 aa  799    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.798701  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2349  glutamine synthetase catalytic region  80.3 
 
 		 472 aa  802    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1939  glutamate--putrescine ligase  80.08 
 
 		 472 aa  800    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.23252 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1506  glutamate--putrescine ligase  80.3 
 
 		 472 aa  802    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2328  glutamine synthetase catalytic region  80.3 
 
 		 472 aa  802    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1533  glutamate--putrescine ligase  79.66 
 
 		 472 aa  792    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1825  glutamate--putrescine ligase  80.3 
 
 		 472 aa  802    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546478 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2068  glutamate--putrescine ligase  84.11 
 
 		 472 aa  835    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01285  hypothetical protein  79.87 
 
 		 472 aa  799    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904201  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3216  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 472 aa  979    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0110604 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1412  glutamate--putrescine ligase  79.87 
 
 		 472 aa  799    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0584  glutamine synthetase catalytic region  53.12 
 
 		 465 aa  478  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  48.21 
 
 		 456 aa  453  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  46.07 
 
 		 458 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  46.07 
 
 		 458 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3247  glutamine synthetase  45.62 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38140  putative glutamine synthetase  45.39 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  46.19 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  45.96 
 
 		 460 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  45.96 
 
 		 460 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  45.39 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  45.39 
 
 		 458 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  44.94 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  45.17 
 
 		 458 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  46.41 
 
 		 460 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0341  L-glutamine synthetase  44.84 
 
 		 459 aa  398  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0727612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  44.94 
 
 		 458 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  44.04 
 
 		 458 aa  395  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  43.6 
 
 		 458 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  43.6 
 
 		 458 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  44.49 
 
 		 458 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  44.8 
 
 		 451 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  41.06 
 
 		 461 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  42.89 
 
 		 444 aa  347  3e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00464  gamma-glutamylputrescine synthetase  42.7 
 
 		 459 aa  336  7e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.446878  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  40.49 
 
 		 459 aa  334  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2336  glutamine synthetase catalytic region  40.58 
 
 		 466 aa  324  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  41.14 
 
 		 455 aa  320  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  38.07 
 
 		 463 aa  318  1e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  41.33 
 
 		 455 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  40.89 
 
 		 455 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  38.91 
 
 		 455 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1568  L-glutamine synthetase  38.68 
 
 		 468 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.719328  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0219  glutamine synthetase, catalytic region  38.46 
 
 		 464 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3049  glutamine synthetase, catalytic region  38.31 
 
 		 464 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.486199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  38.27 
 
 		 455 aa  300  4e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3559  glutamine synthetase, catalytic region  39.06 
 
 		 448 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.610228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  40.44 
 
 		 455 aa  296  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2178  glutamine synthetase, putative  38.84 
 
 		 448 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1785  glutamine synthetase catalytic region  38.84 
 
 		 448 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0866  glutamate--putrescine ligase  38.24 
 
 		 445 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  36.47 
 
 		 453 aa  290  3e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  37.53 
 
 		 443 aa  289  6e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2019  glutamate--ammonia ligase  38.01 
 
 		 445 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0375  L-glutamine synthetase  38.01 
 
 		 445 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0887  glutamine synthetase catalytic region  38.48 
 
 		 459 aa  286  5e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  38.53 
 
 		 454 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  38.41 
 
 		 454 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  38.31 
 
 		 454 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  38.08 
 
 		 459 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  38.19 
 
 		 454 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  38.65 
 
 		 454 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0280  glutamate--putrescine ligase  37.47 
 
 		 452 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5243  glutamate--putrescine ligase  37.03 
 
 		 452 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.689829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  38.57 
 
 		 454 aa  274  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0804  glutamine synthetase, catalytic region  38.19 
 
 		 448 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0418139  normal  0.144728 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5183  glutamine synthetase, putative  36.81 
 
 		 452 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1253  glutamine synthetase, catalytic region  37.78 
 
 		 454 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5090  glutamate--putrescine ligase  36.81 
 
 		 452 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0951  glutamine synthetase catalytic region  37.65 
 
 		 450 aa  273  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1845  glutamine synthetase catalytic region  37.58 
 
 		 451 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561959  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5385  glutamine synthetase catalytic region  37.47 
 
 		 448 aa  273  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3465  glutamine synthetase, catalytic region  37.47 
 
 		 448 aa  273  7e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4901  glutamine synthetase, catalytic region  37.47 
 
 		 448 aa  273  7e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.653152 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  39.02 
 
 		 471 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5309  glutamine synthetase  36.81 
 
 		 452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4867  glutamate--ammonia ligase  36.81 
 
 		 452 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0918007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03880  glutamine synthetase  37.69 
 
 		 452 aa  269  7e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0389  glutamine synthetase  37.69 
 
 		 452 aa  269  8e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5407  L-glutamine synthetase  37.03 
 
 		 452 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000279947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2634  glutamate--putrescine ligase  36.53 
 
 		 448 aa  266  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0507413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48860  putative glutamine synthetase  37.7 
 
 		 453 aa  266  8.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467779  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1406  glutamine synthetase  36.95 
 
 		 451 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.483277  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  37.12 
 
 		 456 aa  264  2e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4806  glutamine synthetase catalytic region  37.42 
 
 		 448 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0777  glutamine synthetase  38.67 
 
 		 456 aa  265  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4278  glutamine synthetase, catalytic region  37.86 
 
 		 448 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702735  normal  0.233785 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1397  glutamate--ammonia ligase  34.95 
 
 		 452 aa  265  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3721  glutamine synthetase catalytic region  36.59 
 
 		 448 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.504584  normal  0.0215831 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1127  L-glutamine synthetase  36.24 
 
 		 479 aa  263  4.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.278504  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0342  L-glutamine synthetase  36.67 
 
 		 452 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2828  L-glutamine synthetase  35.85 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1297  glutamate--putrescine ligase  34.62 
 
 		 463 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770979  normal  0.671991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1130  glutamate--putrescine ligase  34.67 
 
 		 449 aa  260  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2031  glutamate--ammonia ligase  36.18 
 
 		 451 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.794004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0377  L-glutamine synthetase  36.18 
 
 		 451 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1100  Glutamate--putrescine ligase  37.18 
 
 		 458 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2027 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3148  glutamine synthetase, putative  35.56 
 
 		 452 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  36.75 
 
 		 445 aa  259  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2566  glutamate--putrescine ligase  35.56 
 
 		 452 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>