194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1826 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1826  DedA family protein  100 
 
 		 164 aa  325  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.753074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0246  DedA family protein  34.78 
 
 		 176 aa  70.5  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.10117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3981  hypothetical protein  26.83 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2315  hypothetical protein  30.07 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681701  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2977  hypothetical protein  29.5 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0557  DedA family protein  25.62 
 
 		 232 aa  64.7  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.565091  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.57 
 
 		 664 aa  64.7  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2766  SNARE associated Golgi protein  27.5 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  26.87 
 
 		 220 aa  63.9  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1652  hypothetical protein  28.06 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.276221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.21 
 
 		 438 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  27.5 
 
 		 682 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0212  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.49 
 
 		 684 aa  62.4  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  27.5 
 
 		 682 aa  62.4  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  25.38 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  26.87 
 
 		 201 aa  60.8  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.15 
 
 		 676 aa  60.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_004310  BR1333  dedA family protein  26.12 
 
 		 220 aa  60.8  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.914504  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2826  hypothetical protein  30.82 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0614452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0242  hypothetical protein  25.83 
 
 		 684 aa  60.8  0.000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2420  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.22 
 
 		 483 aa  60.5  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  28.1 
 
 		 681 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3947  hypothetical protein  35.51 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3643  hypothetical protein  35.51 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0269  DedA family protein  35.51 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.867407  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.95 
 
 		 668 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  29.37 
 
 		 678 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  29.37 
 
 		 678 aa  58.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  29.53 
 
 		 200 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  26.95 
 
 		 677 aa  57  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3417  hypothetical protein  28.47 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3545  SNARE associated Golgi protein  28.47 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2946  hypothetical protein  28.47 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56313 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  23.42 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2485  DedA family integral membrane protein  29.5 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.99 
 
 		 671 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  26.71 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0055  DedA family protein  31.69 
 
 		 641 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.381333  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  24.68 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00067  conserved inner membrane protein  29.41 
 
 		 254 aa  53.9  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0070  hypothetical protein  29.41 
 
 		 254 aa  53.9  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3592  SNARE associated Golgi protein  29.41 
 
 		 254 aa  53.9  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.305226  hitchhiker  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0057  hypothetical protein  29.41 
 
 		 254 aa  53.9  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00066  hypothetical protein  29.41 
 
 		 254 aa  53.9  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0069  hypothetical protein  29.41 
 
 		 254 aa  53.9  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820004  normal  0.658906 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0069  hypothetical protein  29.41 
 
 		 254 aa  53.9  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3534  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.68 
 
 		 254 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4526  hypothetical protein  22.36 
 
 		 222 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0067  hypothetical protein  29.41 
 
 		 254 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1851  SNARE associated Golgi protein  25.37 
 
 		 220 aa  53.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0732  SNARE associated Golgi protein  29.84 
 
 		 256 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  23.24 
 
 		 219 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0306  hypothetical protein  30.08 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5332  DedA family membrane protein  27.27 
 
 		 672 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.239608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4407  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.4 
 
 		 215 aa  52  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  26.76 
 
 		 219 aa  51.6  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.21 
 
 		 664 aa  51.6  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  24.26 
 
 		 695 aa  51.6  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0612  hypothetical protein  28.26 
 
 		 255 aa  51.2  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.833845  normal  0.0113808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7566  hypothetical protein  26.49 
 
 		 218 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0112  inner membrane protein YabI  27.21 
 
 		 255 aa  50.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.372252 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0109  inner membrane protein YabI  27.21 
 
 		 255 aa  50.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0111  hypothetical protein  27.21 
 
 		 255 aa  50.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.277229 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0116  inner membrane protein YabI  27.21 
 
 		 255 aa  50.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  25.62 
 
 		 437 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3597  DedA family membrane protein  24.36 
 
 		 672 aa  50.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0116  inner membrane protein YabI  27.21 
 
 		 255 aa  50.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0531924 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  26.25 
 
 		 437 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3105  hypothetical protein  28.89 
 
 		 686 aa  49.7  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6468  hypothetical protein  29.55 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.379701  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0615  SNARE associated Golgi protein  28.23 
 
 		 255 aa  48.9  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3501  DedA family membrane protein  26.95 
 
 		 672 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0300275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  30.5 
 
 		 193 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  26.95 
 
 		 204 aa  48.5  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1457  hypothetical protein  24.53 
 
 		 179 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3299  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.67 
 
 		 664 aa  48.5  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  24.84 
 
 		 220 aa  48.5  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  23.64 
 
 		 230 aa  48.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5208  SNARE associated Golgi protein  26.4 
 
 		 241 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3600  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 		 220 aa  47.8  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  23.81 
 
 		 221 aa  47.8  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.53 
 
 		 209 aa  47.8  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3626  SNARE associated Golgi protein  28.69 
 
 		 256 aa  47.8  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  24.03 
 
 		 219 aa  47.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  24.03 
 
 		 219 aa  47.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  24.03 
 
 		 219 aa  47.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  24.03 
 
 		 219 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3815  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.87 
 
 		 256 aa  47  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  24.2 
 
 		 220 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  24.03 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  24.2 
 
 		 220 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3203  SNARE associated Golgi protein  28.78 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.473398  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  24.2 
 
 		 220 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  23.03 
 
 		 219 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  24.38 
 
 		 438 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  24.64 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  24.29 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0139  hypothetical protein  25.36 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1543  DedA family protein  25.97 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.201859  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3351  SNARE associated Golgi protein  31.78 
 
 		 226 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.194662  hitchhiker  0.00788727 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>