31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3605 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3605  SpoIIAA family protein  100 
 
 		 97 aa  198  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0682  SpoIIAA family protein  56.25 
 
 		 94 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0924977 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3339  SpoIIAA family protein  56.25 
 
 		 94 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0683  SpoIIAA family protein  55.21 
 
 		 94 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.575591 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4229  anti-sigma-factor antagonist  51.55 
 
 		 100 aa  94.4  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0519938  hitchhiker  0.000220206 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3950  SpoIIAA family protein  56.25 
 
 		 94 aa  92.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3300  anti-sigma-factor antagonist  52.58 
 
 		 97 aa  90.5  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.128319 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3077  SpoIIAA family protein  46.88 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0725  SpoIIAA family protein  53.12 
 
 		 94 aa  89.4  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3366  SpoIIAA family protein  47.92 
 
 		 107 aa  86.7  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.345505  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0717  SpoIIAA family protein  49.48 
 
 		 94 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3658  SpoIIAA family protein  49.48 
 
 		 94 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0070404  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0726  SpoIIAA family protein  49.48 
 
 		 94 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0696  SpoIIAA family protein  49.48 
 
 		 94 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0737  SpoIIAA family protein  47.92 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0500  SpoIIAA family protein  43.75 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000649364  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3804  anti-sigma-factor antagonist  32.5 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.002729  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4356  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36645  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1702  anti-anti-sigma regulatory factor  42.31 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.39095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0452  putative anti-anti-sigma factor  28.92 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0606923  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1142  putative anti-anti-sigma factor  28.92 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0516  putative anti-sigma B factor antagonist  28.92 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144727  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0285  hypothetical protein  31.87 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0471  anti-sigma-factor antagonist  37.25 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00988083  hitchhiker  0.0000661434 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3627  STAS domain-containing protein  31.46 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.010517  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0292  hypothetical protein  33.7 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  26.32 
 
 		 375 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  29.31 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0741  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.360967  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0764  anti-sigma-factor antagonist  30.91 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>