73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2983 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2983  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  100 
 
 
244 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.682058  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3321  dienelactone hydrolase  63.47 
 
 
224 aa  288  6e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000206123  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3470  dienelactone hydrolase  64.42 
 
 
224 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00399877  hitchhiker  0.000101572 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2763  dienelactone hydrolase  63.68 
 
 
240 aa  263  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.545156  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1365  hypothetical protein  58.88 
 
 
214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.159458  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1351  hypothetical protein  58.38 
 
 
214 aa  241  9e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1390  hypothetical protein  58.38 
 
 
214 aa  241  9e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.136922 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2995  hypothetical protein  57.36 
 
 
214 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170067  hitchhiker  0.00000185469 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2794  hypothetical protein  56.67 
 
 
223 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00486686  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2723  hypothetical protein  56.73 
 
 
223 aa  239  4e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000147001  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1283  hypothetical protein  56.85 
 
 
224 aa  237  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0971816  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2893  hypothetical protein  58.38 
 
 
223 aa  237  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000793472  hitchhiker  0.00000470517 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2564  hypothetical protein  51.42 
 
 
238 aa  224  7e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1534  hypothetical protein  55.84 
 
 
215 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2782  hypothetical protein  51.64 
 
 
236 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0438432  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2428  hypothetical protein  48.21 
 
 
227 aa  203  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.781961  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01184  hypothetical protein  48.21 
 
 
207 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004251  alpha/beta hydrolase  47 
 
 
207 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000929244  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02565  predicted hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  45.45 
 
 
223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19031  esterase/lipase/thioesterase family protein  43.78 
 
 
219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.182153 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3543  hypothetical protein  40.49 
 
 
236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.074661  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0542  hydrolase with alpha/beta-hydrolase fold  41.54 
 
 
214 aa  145  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.52739  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1828  hypothetical protein  38.28 
 
 
224 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44320  hypothetical protein  38.95 
 
 
210 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3772  hypothetical protein  38.95 
 
 
210 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3412  hypothetical protein  37.37 
 
 
262 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16635  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3815  hypothetical protein  38.34 
 
 
231 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.949374  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2598  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  36.97 
 
 
224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000600311  normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2005  hypothetical protein  37.82 
 
 
330 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654426  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4249  hypothetical protein  37.82 
 
 
230 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.962875  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20020  hypothetical protein  37.76 
 
 
213 aa  135  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3568  hypothetical protein  37.82 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1619  hypothetical protein  37.82 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0828333 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0958  esterase/lipase/thioesterase family protein  38.55 
 
 
185 aa  133  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.800343  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2202  hypothetical protein  39.58 
 
 
207 aa  132  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.101227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1783  alpha/beta fold family hydrolase  38.58 
 
 
215 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1152  hypothetical protein  34.91 
 
 
218 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.426204 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1086  putative hydrolase protein  37.82 
 
 
234 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5935  putative hydrolase protein  38.78 
 
 
212 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636652  normal  0.167622 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7072  putative hydrolase protein  37.24 
 
 
213 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00102074  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4300  hypothetical protein  39.77 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0262079  normal  0.176496 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2235  putative hydrolase protein  30.57 
 
 
200 aa  99.4  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114895  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1786  dienelactone hydrolase  35.32 
 
 
228 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000570181 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2029  dienelactone hydrolase  37.36 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0251509  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1145  hypothetical protein  35.56 
 
 
209 aa  92.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0877  hypothetical protein  35.23 
 
 
224 aa  89.7  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000539419  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0527  hypothetical protein  32.49 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.872907  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5819  hypothetical protein  35.03 
 
 
235 aa  82.8  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0532  hypothetical protein  32.49 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7505  hypothetical protein  32.5 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0499  hypothetical protein  32.14 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.146604  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2472  hypothetical protein  34.57 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.26433 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3497  hypothetical protein  35.23 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.427254  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3769  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like  29.36 
 
 
261 aa  75.1  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.200411 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6032  hypothetical protein  31.22 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0960  hypothetical protein  29.89 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.796959  normal  0.0488805 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5559  hypothetical protein  31.22 
 
 
258 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3083  hypothetical protein  32.34 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0359  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold family  33.57 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2337  hypothetical protein  27.47 
 
 
224 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.207577  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1705  hypothetical protein  31.55 
 
 
220 aa  55.5  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0382179  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4023  alpha/beta fold family hydrolase  30.19 
 
 
203 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336562  normal  0.117337 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30750  hypothetical protein  29.14 
 
 
204 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0543148  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4096  hypothetical protein  28.08 
 
 
217 aa  53.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00971169 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2903  hypothetical protein  30.82 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4921  hypothetical protein  35.63 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309743  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0723  hypothetical protein  27.21 
 
 
204 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0992213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3001  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  27.22 
 
 
209 aa  45.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.044134 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3178  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  30.2 
 
 
224 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2427  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  25.69 
 
 
204 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00151914  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2476  hypothetical protein  27.16 
 
 
212 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6294  hypothetical protein  29.27 
 
 
204 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
330 aa  42.4  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>