29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1274 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1274  hypothetical protein  100 
 
 
607 aa  1258    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3674  hypothetical protein  37.84 
 
 
623 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1185  hypothetical protein  37.98 
 
 
616 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2204  hypothetical protein  38.58 
 
 
619 aa  368  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108219  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3851  hypothetical protein  37.44 
 
 
615 aa  349  7e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0140716 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5349  hypothetical protein  37.03 
 
 
625 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184481  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4100  hypothetical protein  33.18 
 
 
631 aa  310  5e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0351  Protein of unknown function DUF1998  33.71 
 
 
580 aa  300  6e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2032  hypothetical protein  32.39 
 
 
564 aa  299  8e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2520  hypothetical protein  34.81 
 
 
632 aa  293  9e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413997  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0227  hypothetical protein  34.32 
 
 
618 aa  289  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00569687 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2729  Protein of unknown function DUF1998  32.66 
 
 
637 aa  284  4.0000000000000003e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0213066  normal  0.652268 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1329  hypothetical protein  32.52 
 
 
620 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2675  hypothetical protein  32.3 
 
 
642 aa  266  8.999999999999999e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  normal  0.830028 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0830  hypothetical protein  29.83 
 
 
689 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748776  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0814  hypothetical protein  29.83 
 
 
671 aa  253  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0467  hypothetical protein  32.13 
 
 
629 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2321  hypothetical protein  29.51 
 
 
670 aa  241  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03290  protein of unknown function (DUF1998)  29.03 
 
 
672 aa  234  5e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328267 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2654  hypothetical protein  30.93 
 
 
641 aa  231  4e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1414  hypothetical protein  26.63 
 
 
635 aa  206  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.751041  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1965  hypothetical protein  27.64 
 
 
600 aa  178  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.644639  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1057  hypothetical protein  28.24 
 
 
607 aa  176  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469365 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4883  hypothetical protein  34.81 
 
 
276 aa  140  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1513  hypothetical protein  23.24 
 
 
644 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426904  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0221  hypothetical protein  26.97 
 
 
741 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2886  hypothetical protein  26.97 
 
 
741 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4913  hypothetical protein  27.56 
 
 
754 aa  48.9  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.717395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  25.12 
 
 
267 aa  45.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>