111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0283 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0283  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  368  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4205  hypothetical protein  75.53 
 
 		 188 aa  267  7e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0392  hypothetical protein  74.47 
 
 		 187 aa  258  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0256  hypothetical protein  69.79 
 
 		 192 aa  242  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal  0.0986563 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0293  hypothetical protein  71.88 
 
 		 193 aa  239  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3847  hypothetical protein  71.88 
 
 		 193 aa  239  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3967  hypothetical protein  70.83 
 
 		 194 aa  235  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0279  hypothetical protein  64.06 
 
 		 190 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00138726  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4069  hypothetical protein  70.31 
 
 		 194 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4044  hypothetical protein  70.31 
 
 		 194 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4162  hypothetical protein  70.31 
 
 		 194 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0322  hypothetical protein  69.79 
 
 		 193 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3651  hypothetical protein  70.83 
 
 		 193 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.676739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3665  hypothetical protein  69.27 
 
 		 194 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.821634  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3329  hypothetical protein  78.7 
 
 		 191 aa  208  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0402  hypothetical protein  69.94 
 
 		 193 aa  201  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  57.47 
 
 		 186 aa  181  7e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5219  hypothetical protein  53.48 
 
 		 188 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.307666 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3541  hypothetical protein  60.49 
 
 		 181 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.193134 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1279  hypothetical protein  59.41 
 
 		 188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2313  hypothetical protein  38.97 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00418629  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1170  hypothetical protein  49.38 
 
 		 201 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.215934  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15731  hypothetical protein  49.07 
 
 		 203 aa  117  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.448321 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2081  hypothetical protein  38.04 
 
 		 178 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12081  hypothetical protein  44.91 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.525189  normal  0.755265 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0249  hypothetical protein  35.23 
 
 		 177 aa  111  8.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00691872  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1874  hypothetical protein  37.44 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2288  hypothetical protein  38.27 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2448  hypothetical protein  38.16 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0162  hypothetical protein  36.42 
 
 		 234 aa  98.6  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  37.76 
 
 		 182 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  33.11 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  26.32 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  26.38 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  32.19 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  30.67 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1497  hypothetical protein  30.07 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.92763  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  32.41 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2847  hypothetical protein  28.86 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1446  hypothetical protein  28.86 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.115639 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  34.82 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  32.35 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  35 
 
 		 231 aa  52  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  32.81 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  31.48 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  30.56 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  27.52 
 
 		 299 aa  51.2  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  28.19 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2167  hypothetical protein  25.81 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3808  hypothetical protein  39.73 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  29.5 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2325  twin-arginine translocation pathway signal  31.48 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00153358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1564  hypothetical protein  30.77 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00127888  normal  0.0974108 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  27.33 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  31.25 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  31.25 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  28.19 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  31.25 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0733  hypothetical protein  30.99 
 
 		 233 aa  48.9  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000336107  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2464  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  48.5  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  28.28 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  25.69 
 
 		 297 aa  48.9  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2347  hypothetical protein  30.28 
 
 		 274 aa  48.5  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1078  twin-arginine translocation pathway signal  28.67 
 
 		 185 aa  48.1  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000165378  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  25.87 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  25.87 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  25.87 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  25.87 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  25.87 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  25.87 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  25.87 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  27.21 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2385  protein of unknown function DUF500  28.93 
 
 		 267 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440615  normal  0.201549 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  25.87 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  27.4 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4764  hypothetical protein  28.24 
 
 		 260 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1331  hypothetical protein  25.56 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4203  putative lipoprotein  32.35 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1471  hypothetical protein  30.25 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  35.09 
 
 		 205 aa  45.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  28.12 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6449  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 195 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.202926 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  28.12 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  25.87 
 
 		 195 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  25.87 
 
 		 195 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  29.41 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  29.17 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0591  twin-arginine translocation pathway signal  31.11 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  26.57 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  27.27 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  29.7 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>