83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5328 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5328  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  100 
 
 		 317 aa  649    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1082  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  48.87 
 
 		 352 aa  300  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2417  Fibronectin type III domain protein  42.95 
 
 		 485 aa  235  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3159  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  39.74 
 
 		 340 aa  216  5e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02265  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  37.84 
 
 		 353 aa  212  9e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0127  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  37.42 
 
 		 347 aa  210  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1238  fibronectin, type III domain-containing protein  40.27 
 
 		 485 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.109718  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2373  fibronectin, type III domain-containing protein  38.68 
 
 		 385 aa  195  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1585  putative depolymerase  39.14 
 
 		 362 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0731101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2303  polyhydroxybutyrate depolymerase  38.82 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1977  polyhydroxybutyrate depolymerase  35.46 
 
 		 369 aa  192  9e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4785  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  35.95 
 
 		 374 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0665  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  36.72 
 
 		 355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.097547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4259  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  36.6 
 
 		 322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2068  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  35.02 
 
 		 358 aa  178  9e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2146  polyhydroxybutyrate depolymerase  37.83 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286329  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2280  hypothetical protein  37.83 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2089  polyhydroxybutyrate depolymerase  37.83 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4772  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  34.91 
 
 		 356 aa  176  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.826591 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5512  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  33.24 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.292347 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0176  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  34.23 
 
 		 375 aa  172  9e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2065  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  34.94 
 
 		 506 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140778  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07987  polyhydroxybutyrate depolymerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03560)  33.92 
 
 		 377 aa  165  6.9999999999999995e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.445833  normal  0.346264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34710  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase protein  33.77 
 
 		 338 aa  162  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.222008  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1647  putative depolymerase  30.22 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543513  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5556  putative depolymerase  27.67 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4864  putative depolymerase  29.2 
 
 		 404 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  33.67 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1940  PHB depolymerase family esterase  35.16 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  38.2 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  30.36 
 
 		 343 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  33.67 
 
 		 344 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1969  esterase, PHB depolymerase  30.7 
 
 		 373 aa  53.5  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.127109  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2204  esterase, PHB depolymerase  31.43 
 
 		 367 aa  53.1  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.667331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  36.11 
 
 		 372 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4273  esterase, PHB depolymerase  37.5 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0535  esterase, PHB depolymerase family  35 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.660761  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0595  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  33.33 
 
 		 364 aa  50.4  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  32.08 
 
 		 544 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  35.82 
 
 		 369 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  32.08 
 
 		 312 aa  50.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0865  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  32.26 
 
 		 367 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0301  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  32.26 
 
 		 367 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  32.95 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3230  PHB depolymerase family esterase  34.33 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4102  hypothetical protein  33.33 
 
 		 385 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.943667 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0332  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  32.26 
 
 		 364 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3759  PHB depolymerase family esterase  34.33 
 
 		 369 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209534 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3867  esterase, PHB depolymerase  33.96 
 
 		 404 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.10201  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1676  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  32.26 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.254076  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5379  putative esterase, PHB depolymerase  37.18 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.449035 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2425  PHB depolymerase family esterase  32.26 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2562  depolymerase  32.26 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1480  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  32.26 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289263  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31730  esterase, PHB depolymerase family  29.01 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  29.32 
 
 		 429 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  34.33 
 
 		 365 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  34.33 
 
 		 365 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  34.33 
 
 		 365 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  31.91 
 
 		 419 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  37.31 
 
 		 396 aa  47  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6025  PHB depolymerase family esterase  31.52 
 
 		 416 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950963  normal  0.103792 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  29.51 
 
 		 398 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  33.33 
 
 		 429 aa  46.6  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  27.98 
 
 		 398 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  29.41 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4615  PHB depolymerase family esterase  40 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  32.84 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4127  esterase, PHB depolymerase family  35.82 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  32.84 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3819  PHB depolymerase family esterase  35.82 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  32.35 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  33.33 
 
 		 419 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  38.33 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4018  hypothetical protein  31.33 
 
 		 355 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1761  esterase, PHB depolymerase family  32.5 
 
 		 422 aa  43.5  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1483  PHB depolymerase family esterase  32.5 
 
 		 422 aa  43.5  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0485134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  40.74 
 
 		 334 aa  43.5  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1658  esterase, PHB depolymerase family  28.99 
 
 		 363 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.044626  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  27.59 
 
 		 398 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1484  esterase, PHB depolymerase family  36.67 
 
 		 425 aa  42.7  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220911  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6240  PHB depolymerase family esterase  31.11 
 
 		 466 aa  42.7  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.721378 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  31.93 
 
 		 387 aa  42.7  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>