33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0964 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0964  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  904    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2102  hypothetical protein  50 
 
 		 485 aa  340  4e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7410  hypothetical protein  36.19 
 
 		 375 aa  192  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8929  hypothetical protein  28.24 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0590592  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8946  hypothetical protein  29.7 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00178879  normal  0.674352 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1439  Ion transport 2 domain protein  39.06 
 
 		 521 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0029  hypothetical protein  27.61 
 
 		 300 aa  90.1  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1689  hypothetical protein  34.32 
 
 		 557 aa  84  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3283  hypothetical protein  32.8 
 
 		 475 aa  83.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6872  hypothetical protein  27.3 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1992  hypothetical protein  30.27 
 
 		 641 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1050  hypothetical protein  33.33 
 
 		 664 aa  76.6  0.0000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1073  hypothetical protein  26.16 
 
 		 464 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4626  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  25.62 
 
 		 602 aa  73.6  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3430  hypothetical protein  28.33 
 
 		 296 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1470  hypothetical protein  25.6 
 
 		 732 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00224315  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0269  hypothetical protein  30.93 
 
 		 481 aa  67  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0126  hypothetical protein  26.15 
 
 		 610 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00047965  normal  0.915629 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0953  hypothetical protein  30.66 
 
 		 731 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0922952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0442  hypothetical protein  30.86 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1996  hypothetical protein  28.31 
 
 		 647 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0882712 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2060  hypothetical protein  33.74 
 
 		 727 aa  60.8  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.697893  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3591  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.56 
 
 		 945 aa  60.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2426  hypothetical protein  30 
 
 		 704 aa  59.7  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0317819 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2836  pentapeptide repeat protein  23.15 
 
 		 368 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2150  hypothetical protein  26.25 
 
 		 313 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6675  hypothetical protein  23.31 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00251998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0650  hypothetical protein  31.91 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.829817 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1181  hypothetical protein  33.67 
 
 		 295 aa  47.4  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.96487  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0032  hypothetical protein  20.8 
 
 		 818 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  27.98 
 
 		 452 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2291  hypothetical protein  23.33 
 
 		 365 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0775084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8605  pentapeptide repeat protein  34.26 
 
 		 354 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101304  normal  0.331567 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>