26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0678 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0678  secretion protein snm4  100 
 
 		 465 aa  900    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.939743  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0990  secretion protein snm4  50.11 
 
 		 470 aa  413  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0265679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0406  secretion protein snm4  42.45 
 
 		 465 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0693  secretion protein snm4  34.22 
 
 		 473 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6572  secretion protein snm4  31.61 
 
 		 464 aa  166  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0608  secretion protein snm4  31.92 
 
 		 468 aa  160  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8100  hypothetical protein  32.48 
 
 		 481 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1209  secretion protein snm4  28.94 
 
 		 472 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04370  secretion protein snm4  28.51 
 
 		 464 aa  137  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0475  hypothetical protein  29.85 
 
 		 462 aa  133  7.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1439  hypothetical protein  33.4 
 
 		 472 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0240093  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3148  secretion protein snm4  29.52 
 
 		 484 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8521  secretion protein snm4  43.44 
 
 		 489 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0138831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4752  hypothetical protein  30.93 
 
 		 467 aa  94.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4838  hypothetical protein  36.5 
 
 		 468 aa  87.8  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1682  secretion protein snm4  24.6 
 
 		 515 aa  84.3  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0940  hypothetical protein  29.94 
 
 		 472 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4811  secretion protein snm4  25.86 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0307  CD9/CD37/CD63 antigen  27.48 
 
 		 451 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00186482  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5967  hypothetical protein  26.96 
 
 		 472 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5564  hypothetical protein  26.96 
 
 		 472 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0944737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3204  protein of unknown function DUF571  30.51 
 
 		 450 aa  50.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.245155 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5455  Fis family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 473 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8475  secretion protein snm4  26.38 
 
 		 498 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0332  secretion protein snm4  24.33 
 
 		 528 aa  44.3  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4617  secretion protein snm4  25.4 
 
 		 441 aa  43.5  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245929  normal  0.704968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>