20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1063 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1063  CRISPR-associated protein, Csn1 family  100 
 
 		 1259 aa  2497    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3120  CRISPR-associated protein, Csn1 family  27.56 
 
 		 1021 aa  195  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0115398  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1029  CRISPR-associated Cas5e family protein  23.95 
 
 		 1064 aa  184  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.169021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1875  CRISPR-associated Cas5e family protein  26.72 
 
 		 984 aa  183  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0709  CRISPR-system-like protein  27.64 
 
 		 1121 aa  181  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4489  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1066 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0060  CRISPR-associated protein, Csn1 family  23.88 
 
 		 1131 aa  157  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0342  CRISPR-associated protein, Csn1 family  30.82 
 
 		 1003 aa  135  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0739339  normal  0.0465454 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0400  CRISPR-associated protein  22.45 
 
 		 1079 aa  117  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.519358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3952  hypothetical protein  21.3 
 
 		 1064 aa  106  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1230  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  28.52 
 
 		 1068 aa  104  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0099  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  23.42 
 
 		 1037 aa  102  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28892  normal  0.129983 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4054  hypothetical protein  26.84 
 
 		 1166 aa  89  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0243  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  25 
 
 		 1195 aa  73.2  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0568  CRISPR-associated protein, Csn1 family  24.91 
 
 		 1426 aa  67  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.596809  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0327  CRISPR-associated Cas5e family protein  25.88 
 
 		 1395 aa  62.8  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  26.82 
 
 		 1138 aa  57.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0453  CRISPR-associated endonuclease Csn1 family protein  22.43 
 
 		 1173 aa  57  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2832  hypothetical protein  30.43 
 
 		 641 aa  54.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.292784  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1477  CRISPR-system-like protein  27.56 
 
 		 1388 aa  45.4  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>