More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0520 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0520  NusG antitermination factor  100 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2954  NusG antitermination factor  50 
 
 		 198 aa  191  5e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000249386  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  40.54 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  42.39 
 
 		 175 aa  141  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  41.3 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  40.22 
 
 		 175 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  39.13 
 
 		 174 aa  139  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  41.15 
 
 		 181 aa  138  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  44.02 
 
 		 176 aa  138  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  38.38 
 
 		 175 aa  138  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  37.84 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  37.84 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  40 
 
 		 175 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  42.7 
 
 		 175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  40.64 
 
 		 177 aa  132  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  38.83 
 
 		 181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  37.23 
 
 		 180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  39.56 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  38.59 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  38.59 
 
 		 172 aa  128  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  41.67 
 
 		 178 aa  127  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  41.18 
 
 		 177 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  39.36 
 
 		 183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0583  NusG antitermination factor  36.02 
 
 		 203 aa  120  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  34.92 
 
 		 243 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  35.29 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  36.02 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  33.16 
 
 		 250 aa  119  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  37.23 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  39.13 
 
 		 174 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  37.5 
 
 		 173 aa  118  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  37.5 
 
 		 173 aa  118  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  34.95 
 
 		 202 aa  117  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4447  transcription antitermination protein nusG  34.41 
 
 		 199 aa  117  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  33.87 
 
 		 198 aa  117  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  35.64 
 
 		 273 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  32.29 
 
 		 266 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  34.34 
 
 		 272 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3456  transcription antitermination protein NusG  35.48 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147926  normal  0.436073 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  35.29 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  33.84 
 
 		 280 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  35.29 
 
 		 193 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  35.64 
 
 		 277 aa  115  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  35.98 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  35.98 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  34.74 
 
 		 178 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  36.36 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  36.36 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  36.36 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  36.36 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  36.36 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  36.36 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  36.36 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  33.33 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  35.45 
 
 		 182 aa  114  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  35.83 
 
 		 185 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  35.83 
 
 		 185 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  35.83 
 
 		 185 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  35.83 
 
 		 185 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  35.29 
 
 		 177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  35.83 
 
 		 185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  35.83 
 
 		 185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  35.83 
 
 		 185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  35.83 
 
 		 185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  35.64 
 
 		 185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  32.29 
 
 		 238 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  35.29 
 
 		 177 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  31.66 
 
 		 266 aa  114  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3902  transcription antitermination protein nusG  33.87 
 
 		 196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  35.11 
 
 		 185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  35.11 
 
 		 185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3251  NusG antitermination factor  33.87 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  30.98 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  35.14 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  34.04 
 
 		 177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0505  NusG antitermination factor  33.87 
 
 		 194 aa  112  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  32.18 
 
 		 306 aa  112  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3039  transcription antitermination protein NusG  34.22 
 
 		 194 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  34.05 
 
 		 177 aa  111  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  34.76 
 
 		 176 aa  111  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  32.8 
 
 		 197 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  32.98 
 
 		 185 aa  111  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  31 
 
 		 267 aa  111  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  30.88 
 
 		 299 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  34.95 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  33.16 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  32.8 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1422  transcription antitermination protein nusG  34.54 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.002098  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0268  transcription antitermination protein nusG  35.6 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000582831  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  33.16 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  34.05 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  33.51 
 
 		 177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  40.43 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  34.54 
 
 		 242 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1532  NusG antitermination factor  36.41 
 
 		 174 aa  109  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04536  transcription antitermination protein NusG  30.85 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  32.8 
 
 		 177 aa  109  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0744  transcription antitermination protein NusG  31.38 
 
 		 186 aa  109  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000594191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  34.05 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  39.89 
 
 		 177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>