57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4598 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4598  glycosyltransferase family 28 protein  100 
 
 		 384 aa  751    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312674  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5976  Glycosyltransferase 28 domain  60.85 
 
 		 382 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211682  normal  0.611684 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7129  Glycosyltransferase 28 domain protein  60.05 
 
 		 381 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.379317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3925  hypothetical protein  60.29 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2827  glycosyl transferase-like protein  40.26 
 
 		 650 aa  229  9e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0735  hypothetical protein  38.54 
 
 		 401 aa  206  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6473  glycosyltransferase family 28 protein  43.01 
 
 		 671 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0174404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3692  hypothetical protein  35.53 
 
 		 379 aa  197  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.833754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7225  Glycosyltransferase 28 domain protein  42.6 
 
 		 671 aa  192  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498881  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0254  hypothetical protein  39.58 
 
 		 374 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.965107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0356  hypothetical protein  34.55 
 
 		 386 aa  159  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2358  putative glycosyltransferase protein  35.43 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0125042  normal  0.920267 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0739  hypothetical protein  25.26 
 
 		 391 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2825  hypothetical protein  30.92 
 
 		 416 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791946  normal  0.436894 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3688  hypothetical protein  30.38 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.112899 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0614  hypothetical protein  27.94 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0765  glycosyl transferase-like protein  27.94 
 
 		 472 aa  101  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.51798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1994  putative glycosyltransferase  29.6 
 
 		 386 aa  97.1  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0252697  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6470  RedA-like protein  30.46 
 
 		 394 aa  92  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0204  response regulator receiver protein  29 
 
 		 474 aa  91.3  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0360  hypothetical protein  23.45 
 
 		 391 aa  89.7  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4270  hypothetical protein  25 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0333  Glycosyltransferase 28 domain protein  22.25 
 
 		 414 aa  86.7  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4330  hypothetical protein  24.75 
 
 		 427 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0675545 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2432  hypothetical protein  25.06 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3927  hypothetical protein  27.45 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4596  putative membrane-anchored protein  26.11 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.576563  normal  0.938247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7222  RedA-like protein  29.66 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7127  membrane-anchored protein  23.35 
 
 		 402 aa  72.8  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5974  membrane-anchored protein  23.13 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.951983  normal  0.842489 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3905  glycosyltransferase family 28 protein  24.46 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0957738 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3666  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  35.29 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231982  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3947  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  26.27 
 
 		 386 aa  50.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3868  glycosyltransferase family 28 protein  27.76 
 
 		 527 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.479264  normal  0.241184 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0508  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  26.92 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0716  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  23.76 
 
 		 339 aa  47.8  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0491  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  26.28 
 
 		 358 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.78794  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2202  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  27.17 
 
 		 358 aa  47.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0410  Undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptidebeta- N -acetylglucosaminyltransferase  24.82 
 
 		 357 aa  47  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.823553  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2760  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  29.86 
 
 		 367 aa  47  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.847601  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0783  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  34.48 
 
 		 364 aa  47  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.653399 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2356  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  28.87 
 
 		 369 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.032317  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0692  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  23.2 
 
 		 339 aa  46.2  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2107  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  34.48 
 
 		 364 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2941  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  28.57 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.160396 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0693  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  33.33 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.421793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3124  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  28.57 
 
 		 370 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.612941  normal  0.474268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3168  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  28.57 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1277  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N- acetylglucosamine transferase  33.71 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3506  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  24.84 
 
 		 360 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3884  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  32.94 
 
 		 381 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.321848  normal  0.560072 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2147  N-acetylglucosaminyltransferase, MurG  29.28 
 
 		 358 aa  44.3  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4157  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  24.06 
 
 		 351 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.780678 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0462  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  32.67 
 
 		 367 aa  43.9  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.314314  normal  0.188661 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0692  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  29.1 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.727607  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4117  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine transferase  24.06 
 
 		 351 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2799  hypothetical protein  27.93 
 
 		 410 aa  42.7  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.516994  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>