191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4531 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4531  carbohydrate kinase  100 
 
 		 178 aa  361  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3755  carbohydrate kinase  59.62 
 
 		 166 aa  191  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0395  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  54.6 
 
 		 179 aa  190  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104744 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0840  gluconokinase  53.29 
 
 		 181 aa  189  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4512  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  54.82 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6413  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  55.76 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00235044  normal  0.475795 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0427  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  55.69 
 
 		 178 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133894 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.88 
 
 		 759 aa  170  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  52.6 
 
 		 779 aa  168  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2408  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  53.01 
 
 		 176 aa  165  4e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.949742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5034  gluconokinase  48.75 
 
 		 167 aa  160  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3761  carbohydrate kinase  51.25 
 
 		 195 aa  154  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117774  decreased coverage  0.00501521 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4571  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.93 
 
 		 163 aa  154  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.992744  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3416  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  52.5 
 
 		 179 aa  154  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0373306  normal  0.327266 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2346  carbohydrate kinase  52.5 
 
 		 179 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2524  carbohydrate kinase  51.88 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3337  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  51.27 
 
 		 175 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00678717 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2932  carbohydrate kinase  48.1 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4020  thermoresistant gluconokinase  46.95 
 
 		 167 aa  149  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3525  gluconate kinase  50.33 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263705  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4788  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.17 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27310  gluconokinase  50.32 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1235  carbohydrate kinase  50 
 
 		 189 aa  149  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4107  thermoresistant gluconokinase  46.95 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0136  carbohydrate kinase  46.95 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3045  carbohydrate kinase  46.47 
 
 		 175 aa  148  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.383801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24180  gluconate kinase  50.93 
 
 		 174 aa  149  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.0373923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2785  carbohydrate kinase  51.9 
 
 		 179 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3564  gluconokinase  51.95 
 
 		 162 aa  147  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00350968  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00513  gluconate kinase  45 
 
 		 173 aa  147  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  44.24 
 
 		 429 aa  147  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1469  thermosensitive gluconokinase  46.34 
 
 		 178 aa  147  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3640  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.43 
 
 		 176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0666  thermosensitive gluconokinase  43.37 
 
 		 174 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.337955  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34640  gluconokinase  49.01 
 
 		 173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.425531  normal  0.105648 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0216  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.51 
 
 		 172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2769  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.4 
 
 		 175 aa  145  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2577  carbohydrate kinase  48.1 
 
 		 164 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313966 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2356  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.11 
 
 		 182 aa  145  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.63212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4336  gluconate kinase  46.54 
 
 		 177 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2665  thermoresistant gluconokinase  43.83 
 
 		 171 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2939  gluconokinase  46.84 
 
 		 173 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2124  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.15 
 
 		 174 aa  145  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1801  thermosensitive gluconokinase  46.01 
 
 		 178 aa  144  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.688774  normal  0.112743 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1575  carbohydrate kinase  46.01 
 
 		 178 aa  144  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.157856  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4870  D-gluconate kinase  44.17 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0564228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0502  carbohydrate kinase  47.74 
 
 		 170 aa  142  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4740  D-gluconate kinase  45.28 
 
 		 176 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0672986 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4889  D-gluconate kinase  45.28 
 
 		 176 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.11956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0365  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.39 
 
 		 176 aa  142  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4833  D-gluconate kinase  45.28 
 
 		 176 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3674  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  44.58 
 
 		 180 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001959  gluconokinase  41.21 
 
 		 174 aa  142  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1220  thermoresistant gluconokinase  47.24 
 
 		 173 aa  141  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3367  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.17 
 
 		 165 aa  141  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.000000649904 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2114  gluconate kinase  46.5 
 
 		 170 aa  140  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0592  gluconate kinase  46.84 
 
 		 165 aa  140  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22480  gluconokinase  48.05 
 
 		 174 aa  140  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4770  D-gluconate kinase  44.65 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.210509  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3943  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.17 
 
 		 170 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1888  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  47.4 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0855471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4159  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.67 
 
 		 182 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134532  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1876  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.31 
 
 		 182 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.616409  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3252  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.31 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.507314  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2443  thermoresistant gluconokinase  46.63 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3439  shikimate kinase  46.63 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0316  carbohydrate kinase  45.57 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0359  thermoresistant gluconokinase  46.63 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1217  thermoresistant gluconokinase  46.63 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3403  putative thermoresistant gluconokinase  46.63 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3437  putative thermoresistant gluconokinase  46.63 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2628  thermoresistant gluconokinase  46.63 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0043609  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2569  carbohydrate kinase  46.31 
 
 		 373 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00777638  hitchhiker  0.0000000380765 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0595  carbohydrate kinase  48.24 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3978  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.12 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0266  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.4 
 
 		 175 aa  139  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0596402  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3722  gluconate kinase  49.67 
 
 		 160 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5911  carbohydrate kinase  49.36 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2053  carbohydrate kinase  49.69 
 
 		 182 aa  139  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402003  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0876  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50 
 
 		 183 aa  138  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.868196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2070  carbohydrate kinase  48.43 
 
 		 174 aa  138  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3436  carbohydrate kinase  50.34 
 
 		 166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4056  carbohydrate kinase  44.12 
 
 		 191 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5548  carbohydrate kinase  48.73 
 
 		 180 aa  137  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5328  gluconate kinase  48.34 
 
 		 171 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5417  gluconate kinase  48.34 
 
 		 171 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5707  gluconate kinase  48.34 
 
 		 171 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.787187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4087  carbohydrate kinase  44.64 
 
 		 191 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4174  carbohydrate kinase  44.64 
 
 		 191 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0584  carbohydrate kinase  46.84 
 
 		 167 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170664  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0558  carbohydrate kinase  46.84 
 
 		 167 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0162  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.1 
 
 		 181 aa  136  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0555  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.74 
 
 		 167 aa  136  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3729  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  39.88 
 
 		 187 aa  135  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3028  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.47 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3478  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  46.25 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1226  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.17 
 
 		 178 aa  135  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04098  hypothetical protein  39.88 
 
 		 187 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4749  D-gluconate kinase  39.88 
 
 		 187 aa  135  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2720  carbohydrate kinase  46.84 
 
 		 167 aa  136  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>