More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3201 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  100 
 
 		 296 aa  593  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  78.72 
 
 		 293 aa  471  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  78.26 
 
 		 293 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  77.7 
 
 		 292 aa  458  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  63.51 
 
 		 293 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  63.51 
 
 		 293 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  63.51 
 
 		 293 aa  368  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  61.15 
 
 		 288 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  52.77 
 
 		 303 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  54.52 
 
 		 297 aa  319  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  53.92 
 
 		 293 aa  305  6e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  54.97 
 
 		 297 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  53.56 
 
 		 296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  50 
 
 		 298 aa  298  8e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  53.22 
 
 		 296 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  53.29 
 
 		 303 aa  294  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  51.86 
 
 		 294 aa  289  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1837  parB-like partition protein  54.67 
 
 		 305 aa  288  7e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  53.08 
 
 		 294 aa  287  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  50.51 
 
 		 293 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  50.67 
 
 		 299 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  53.56 
 
 		 296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  49.66 
 
 		 300 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  46.84 
 
 		 301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  47.49 
 
 		 299 aa  265  8e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  49.15 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  50.17 
 
 		 306 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  48.32 
 
 		 301 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  50.68 
 
 		 292 aa  263  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  48.97 
 
 		 296 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2960  chromosome segregation DNA-binding protein  50.17 
 
 		 306 aa  259  4e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1586  parB-like partition protein  51.01 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  0.0130059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1653  parB-like partition protein  50.34 
 
 		 300 aa  256  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.854391 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1865  parB-like partition protein  50.67 
 
 		 298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0917667 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  49.81 
 
 		 326 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2849  chromosome segregation DNA-binding protein  51.01 
 
 		 298 aa  242  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573322  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  45.82 
 
 		 315 aa  241  7.999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  45.08 
 
 		 319 aa  232  6e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  41.47 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  42.91 
 
 		 292 aa  228  7e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  45.89 
 
 		 296 aa  227  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  42.76 
 
 		 289 aa  225  8e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  46.28 
 
 		 298 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  44.29 
 
 		 290 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  43.4 
 
 		 284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  44.11 
 
 		 295 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  44.11 
 
 		 295 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  44.11 
 
 		 295 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  44.11 
 
 		 295 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  44.11 
 
 		 295 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  44.11 
 
 		 295 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  44.11 
 
 		 295 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  44.11 
 
 		 295 aa  218  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  42.32 
 
 		 294 aa  218  7.999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  44.75 
 
 		 295 aa  218  8.999999999999998e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  43.94 
 
 		 290 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  43.94 
 
 		 290 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  43.77 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  38.49 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  42.14 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  43.77 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  43.6 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  43.77 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  43.77 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  43.77 
 
 		 305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  44.25 
 
 		 290 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  43.9 
 
 		 290 aa  215  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  43.75 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  42.95 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  41.81 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  43.43 
 
 		 290 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0018  parB-like partition protein  41.5 
 
 		 296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0417799  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  42.86 
 
 		 305 aa  211  9e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  44.37 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  38.33 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  43.15 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  41.36 
 
 		 309 aa  210  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  44.29 
 
 		 291 aa  209  5e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  43.3 
 
 		 294 aa  209  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  44.03 
 
 		 286 aa  209  6e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  39.25 
 
 		 286 aa  208  7e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  44.93 
 
 		 298 aa  208  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  44.93 
 
 		 298 aa  208  8e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  42.42 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  44.59 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  42.42 
 
 		 295 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  41.47 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  42.32 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  41.41 
 
 		 310 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  43.36 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0015  parB-like partition protein  41.16 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000218674  hitchhiker  0.000314098 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  41.08 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  40.89 
 
 		 300 aa  205  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  42.91 
 
 		 298 aa  205  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  43.67 
 
 		 256 aa  205  7e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  41.02 
 
 		 294 aa  205  7e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  40.88 
 
 		 303 aa  205  8e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  40.89 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  39.52 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  43.06 
 
 		 286 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>