More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2416 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 455 aa  924    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  53.1 
 
 		 439 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  52.04 
 
 		 443 aa  463  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0866  glutamate--putrescine ligase  52.71 
 
 		 445 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0375  L-glutamine synthetase  52.49 
 
 		 445 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2019  glutamate--ammonia ligase  52.49 
 
 		 445 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  49.44 
 
 		 451 aa  434  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  50.23 
 
 		 444 aa  423  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1127  L-glutamine synthetase  49.21 
 
 		 479 aa  398  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.278504  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2336  glutamine synthetase catalytic region  42.44 
 
 		 466 aa  352  5.9999999999999994e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  41.02 
 
 		 456 aa  351  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  39.78 
 
 		 458 aa  346  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  39.78 
 
 		 458 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3247  glutamine synthetase  39.69 
 
 		 458 aa  342  9e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  39.37 
 
 		 458 aa  341  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  43.51 
 
 		 453 aa  342  1e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38140  putative glutamine synthetase  39.46 
 
 		 458 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  38.7 
 
 		 458 aa  339  7e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  38.93 
 
 		 458 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  38.7 
 
 		 458 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  38.7 
 
 		 458 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  38.12 
 
 		 458 aa  336  5e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0341  L-glutamine synthetase  38.84 
 
 		 459 aa  334  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0727612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  37.89 
 
 		 458 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  37.89 
 
 		 458 aa  332  8e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0777  glutamine synthetase  43.34 
 
 		 456 aa  332  8e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  39.6 
 
 		 461 aa  332  8e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  37.67 
 
 		 458 aa  326  4.0000000000000003e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  38.81 
 
 		 460 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  38.81 
 
 		 460 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  38.81 
 
 		 460 aa  322  8e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  38.81 
 
 		 460 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2068  glutamate--putrescine ligase  38.48 
 
 		 472 aa  315  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3216  glutamine synthetase catalytic region  38.91 
 
 		 472 aa  309  5e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0110604 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00464  gamma-glutamylputrescine synthetase  40.5 
 
 		 459 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.446878  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  39.72 
 
 		 455 aa  297  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2349  glutamine synthetase catalytic region  37.5 
 
 		 472 aa  296  5e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1506  glutamate--putrescine ligase  37.5 
 
 		 472 aa  296  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1825  glutamate--putrescine ligase  37.5 
 
 		 472 aa  296  5e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546478 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2328  glutamine synthetase catalytic region  37.5 
 
 		 472 aa  296  5e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1939  glutamate--putrescine ligase  37.5 
 
 		 472 aa  296  6e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.23252 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01274  gamma-Glu-putrescine synthase  37.28 
 
 		 472 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.798701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01285  hypothetical protein  37.28 
 
 		 472 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1412  glutamate--putrescine ligase  37.28 
 
 		 472 aa  294  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0951  glutamine synthetase catalytic region  39.5 
 
 		 450 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1533  glutamate--putrescine ligase  37.28 
 
 		 472 aa  292  9e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1406  glutamine synthetase  38.27 
 
 		 451 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.483277  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  35.98 
 
 		 463 aa  288  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  37.61 
 
 		 459 aa  286  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1568  L-glutamine synthetase  38.41 
 
 		 468 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.719328  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  37.92 
 
 		 459 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  38.27 
 
 		 454 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3049  glutamine synthetase, catalytic region  36.97 
 
 		 464 aa  285  9e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.486199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  37.42 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0219  glutamine synthetase, catalytic region  38.18 
 
 		 464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  37.7 
 
 		 454 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0887  glutamine synthetase catalytic region  37.89 
 
 		 459 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  37.39 
 
 		 455 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  37.53 
 
 		 455 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  38.51 
 
 		 454 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  36.65 
 
 		 455 aa  279  6e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  38.29 
 
 		 454 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1100  Glutamate--putrescine ligase  38.62 
 
 		 458 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2027 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  37.47 
 
 		 454 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  36.88 
 
 		 471 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1252  L-glutamine synthetase  34.52 
 
 		 450 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  35.7 
 
 		 455 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  36.12 
 
 		 476 aa  261  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  35.89 
 
 		 476 aa  259  6e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  35.15 
 
 		 476 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0342  L-glutamine synthetase  35.51 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  34.41 
 
 		 456 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0584  glutamine synthetase catalytic region  35.47 
 
 		 465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0389  glutamine synthetase  34.38 
 
 		 452 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03880  glutamine synthetase  34.38 
 
 		 452 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5407  L-glutamine synthetase  34.38 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000279947 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0295  putative glutamine synthetase  34.08 
 
 		 475 aa  251  2e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2897  glutamate--putrescine ligase  35.86 
 
 		 452 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2864  glutamate--ammonia ligase  33.98 
 
 		 459 aa  250  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.149371 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0161  L-glutamine synthetase  35.52 
 
 		 475 aa  250  4e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636195  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5914  glutamate--ammonia ligase  35.01 
 
 		 444 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  35.01 
 
 		 444 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5309  glutamine synthetase  34.44 
 
 		 452 aa  249  6e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4867  glutamate--ammonia ligase  34.44 
 
 		 452 aa  249  9e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0918007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2079  L-glutamine synthetase  34.45 
 
 		 454 aa  249  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5549  glutamate--ammonia ligase  35.01 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48860  putative glutamine synthetase  33.48 
 
 		 453 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467779  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0945  glutamate--putrescine ligase  33.56 
 
 		 449 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3572  glutamate--putrescine ligase  35.73 
 
 		 444 aa  247  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.701465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2707  glutamate--putrescine ligase  34.3 
 
 		 452 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210959  normal  0.606055 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5183  glutamine synthetase, putative  33.04 
 
 		 452 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2828  L-glutamine synthetase  33.64 
 
 		 468 aa  246  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3148  glutamine synthetase, putative  34.08 
 
 		 452 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5243  glutamate--putrescine ligase  33.04 
 
 		 452 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.689829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2566  glutamate--putrescine ligase  34.08 
 
 		 452 aa  246  8e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1739  glutamate--putrescine ligase  34.92 
 
 		 454 aa  245  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000378796 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1130  glutamate--putrescine ligase  34.1 
 
 		 449 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0972  glutamate--ammonia ligase  34.03 
 
 		 449 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00809428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0280  glutamate--putrescine ligase  32.81 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4666  Glutamate--putrescine ligase  34.6 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>