37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0886 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0886  hypothetical protein  100 
 
 		 2113 aa  4128    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0571  hypothetical protein  36.61 
 
 		 2682 aa  747    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0885  hypothetical protein  37.43 
 
 		 788 aa  99.4  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.854858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  39.52 
 
 		 2767 aa  97.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  36.21 
 
 		 4687 aa  92  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  38.15 
 
 		 940 aa  88.2  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  38.73 
 
 		 1789 aa  87.4  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  36.42 
 
 		 1814 aa  82  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  36.42 
 
 		 2107 aa  81.3  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 1607 aa  77.8  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  32.14 
 
 		 1925 aa  74.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  32.86 
 
 		 1544 aa  73.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  29.53 
 
 		 679 aa  64.3  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  28.65 
 
 		 959 aa  63.9  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2746  hypothetical protein  34.52 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1250  hypothetical protein  27.36 
 
 		 541 aa  61.6  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  29.02 
 
 		 4798 aa  61.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1000  Hemolysin-type calcium-binding region  26.43 
 
 		 844 aa  59.7  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.862975  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2962  hypothetical protein  31.87 
 
 		 326 aa  58.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0055172  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  30.43 
 
 		 1805 aa  57.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  32.41 
 
 		 1112 aa  56.6  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  28.17 
 
 		 2911 aa  55.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  29.93 
 
 		 585 aa  55.8  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  31.55 
 
 		 1809 aa  54.3  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  26.68 
 
 		 1490 aa  54.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1901  hypothetical protein  28.28 
 
 		 435 aa  53.9  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  26.37 
 
 		 3209 aa  51.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4716  hypothetical protein  31.07 
 
 		 337 aa  50.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  25.44 
 
 		 386 aa  48.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0514  hypothetical protein  28.24 
 
 		 351 aa  48.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241085  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  29.93 
 
 		 582 aa  49.3  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2875  hypothetical protein  34.29 
 
 		 435 aa  47.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1931  hypothetical protein  28.65 
 
 		 354 aa  47.4  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.349657  normal  0.547729 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1186  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  25.88 
 
 		 618 aa  47  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0332  membrane protein  30.4 
 
 		 422 aa  46.6  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.797962  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1306 aa  46.6  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3748  hypothetical protein  25.6 
 
 		 463 aa  46.2  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>