35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3571 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3571  hypothetical protein  100 
 
 		 468 aa  927    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.489083 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3613  HipA domain protein  39.69 
 
 		 443 aa  257  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0664  hypothetical protein  38.02 
 
 		 447 aa  236  7e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1570  hypothetical protein  40.22 
 
 		 451 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0903  hypothetical protein  37.07 
 
 		 462 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4855  hypothetical protein  39.91 
 
 		 452 aa  216  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.874241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2168  hypothetical protein  40.99 
 
 		 430 aa  210  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.146137 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0727  hypothetical protein  33.1 
 
 		 443 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13683  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4986  hypothetical protein  37.89 
 
 		 319 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  32.97 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  30.24 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  29.24 
 
 		 415 aa  53.9  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  31.11 
 
 		 435 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  27.93 
 
 		 408 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  30 
 
 		 417 aa  51.2  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  27.37 
 
 		 420 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  31.25 
 
 		 387 aa  50.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  29.89 
 
 		 420 aa  50.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  26.16 
 
 		 414 aa  50.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  27.37 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  29.89 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  29.08 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  27.49 
 
 		 415 aa  48.5  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  28.98 
 
 		 430 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  26.29 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  28.41 
 
 		 440 aa  47.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  32.26 
 
 		 412 aa  46.6  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  28.21 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  32.03 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  28.35 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  30.57 
 
 		 450 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  29.89 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  27.49 
 
 		 415 aa  45.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  28.74 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  25.91 
 
 		 407 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>