41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0373 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0373  hypothetical protein  100 
 
 
737 aa  1496    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6054  hypothetical protein  36.87 
 
 
747 aa  432  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  27.75 
 
 
655 aa  98.2  5e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  24.71 
 
 
728 aa  80.9  0.00000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  24.71 
 
 
728 aa  80.5  0.00000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  24.31 
 
 
728 aa  79  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  23.26 
 
 
741 aa  68.9  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  27.51 
 
 
1146 aa  66.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  27.51 
 
 
1146 aa  66.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  27.35 
 
 
1145 aa  64.3  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1406  hypothetical protein  23.72 
 
 
914 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  42.67 
 
 
789 aa  58.9  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4145  hypothetical protein  24.82 
 
 
690 aa  56.6  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  42.03 
 
 
674 aa  54.7  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  37.35 
 
 
615 aa  53.1  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3460  hypothetical protein  26.86 
 
 
659 aa  51.6  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3239  hypothetical protein  25.58 
 
 
669 aa  50.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.983308  normal  0.678486 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3727  hypothetical protein  26.86 
 
 
764 aa  50.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  42.47 
 
 
679 aa  50.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  36.21 
 
 
605 aa  49.7  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  41.43 
 
 
693 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3241  hypothetical protein  25.64 
 
 
701 aa  48.9  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.424081  normal  0.24585 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  28.18 
 
 
390 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3806  GTP-binding protein, HSR1-related  40.68 
 
 
527 aa  48.5  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0425817  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  48.89 
 
 
614 aa  48.1  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  34.83 
 
 
569 aa  48.1  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  25.2 
 
 
693 aa  47.8  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  27.36 
 
 
692 aa  47.4  0.0009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  33.71 
 
 
569 aa  47.4  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  36.92 
 
 
614 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  32.28 
 
 
952 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  36.92 
 
 
614 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  38.6 
 
 
588 aa  47.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  39.68 
 
 
610 aa  46.6  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  44.44 
 
 
407 aa  46.6  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  32.58 
 
 
569 aa  45.4  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  50 
 
 
587 aa  45.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0777  GTP-binding protein EngA  29.51 
 
 
462 aa  44.7  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  48.94 
 
 
585 aa  44.7  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  31.54 
 
 
602 aa  44.3  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  28.42 
 
 
1228 aa  43.9  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>