More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5839 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5839  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 343 aa  702    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2894  UDP-glucose 4-epimerase  65.57 
 
 		 339 aa  455  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_002950  PG0347  UDP-glucose 4-epimerase  60.42 
 
 		 342 aa  399  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0730081 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0923  UDP-glucose 4-epimerase  56.42 
 
 		 341 aa  387  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000616826  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1728  UDP-glucose 4-epimerase  53.43 
 
 		 338 aa  369  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.87625  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03925  UDP-glucose 4-epimerase  55.82 
 
 		 340 aa  367  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.317311  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3613  UDP-glucose 4-epimerase  55.52 
 
 		 340 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.965696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0182  UDP-glucose 4-epimerase  50.75 
 
 		 342 aa  340  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1059  UDP-glucose 4-epimerase  51.81 
 
 		 336 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0878912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  50.9 
 
 		 337 aa  333  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0346  UDP-glucose 4-epimerase  50.89 
 
 		 351 aa  329  5.0000000000000004e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  51.81 
 
 		 337 aa  328  8e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  50.3 
 
 		 337 aa  328  8e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3477  UDP-glucose 4-epimerase  48.05 
 
 		 340 aa  325  8.000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.350304 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1892  UDP-galactose 4-epimerase  49.12 
 
 		 377 aa  320  3e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  47.75 
 
 		 337 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1753  UDP-glucose 4-epimerase  47.45 
 
 		 339 aa  318  6e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0261532  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  50.3 
 
 		 337 aa  318  9e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 339 aa  317  2e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0593  UDP-glucose 4-epimerase  48.19 
 
 		 339 aa  317  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  48.48 
 
 		 337 aa  316  5e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  47.75 
 
 		 338 aa  315  7e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  47.88 
 
 		 339 aa  315  7e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2271  UDP-glucose 4-epimerase  48.68 
 
 		 340 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.133855 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0571  UDP-glucose 4-epimerase  46.97 
 
 		 337 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  48.34 
 
 		 337 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  48.79 
 
 		 337 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  49.09 
 
 		 341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  48.04 
 
 		 337 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  47.73 
 
 		 337 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  48.34 
 
 		 337 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  47.88 
 
 		 338 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  48.18 
 
 		 338 aa  311  9e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  48.18 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  48.48 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  48.18 
 
 		 338 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2015  UDP-glucose 4-epimerase  47.45 
 
 		 339 aa  311  1e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  48.49 
 
 		 335 aa  310  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  48.49 
 
 		 335 aa  309  4e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  47.58 
 
 		 338 aa  309  4e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3395  UDP-glucose 4-epimerase  46.08 
 
 		 338 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.349492  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07350  UDP-galactose 4-epimerase  48.18 
 
 		 339 aa  308  8e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  46.53 
 
 		 336 aa  308  9e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  47.88 
 
 		 337 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  47.88 
 
 		 337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  46.99 
 
 		 336 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  47.58 
 
 		 337 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  47.58 
 
 		 337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0737  UDP-glucose 4-epimerase  49.24 
 
 		 339 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  46.36 
 
 		 338 aa  305  6e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  46.36 
 
 		 338 aa  305  6e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  47.88 
 
 		 337 aa  305  6e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1848  UDP-glucose 4-epimerase  48.94 
 
 		 337 aa  305  7e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  46.97 
 
 		 342 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  47.89 
 
 		 335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  44.77 
 
 		 351 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3334  UDP-glucose 4-epimerase  45.05 
 
 		 342 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.618075  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1413  UDP-galactose-4-epimerase  46.99 
 
 		 338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0789  UDP-galactose 4-epimerase  46.22 
 
 		 338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1793  UDP-glucose 4-epimerase  45.15 
 
 		 341 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  46.36 
 
 		 338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  45.92 
 
 		 342 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  46.67 
 
 		 338 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  46.06 
 
 		 338 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  46.06 
 
 		 338 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  46.97 
 
 		 339 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  45.95 
 
 		 338 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  45.95 
 
 		 338 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  45.95 
 
 		 338 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  45.32 
 
 		 339 aa  302  5.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  47.2 
 
 		 340 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  45.95 
 
 		 338 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0786  UDP-galactose-4-epimerase  45.95 
 
 		 338 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1075  UDP-glucose 4-epimerase  44.74 
 
 		 342 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.320061  normal  0.011198 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  46.06 
 
 		 338 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0680  UDP-galactose-4-epimerase  45.95 
 
 		 338 aa  302  6.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2943  UDP-galactose-4-epimerase  46.69 
 
 		 338 aa  302  7.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  45.18 
 
 		 341 aa  302  7.000000000000001e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0862  UDP-galactose-4-epimerase  45.95 
 
 		 338 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0889309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2855  UDP-galactose-4-epimerase  46.69 
 
 		 338 aa  302  7.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3246  UDP-glucose 4-epimerase  46.36 
 
 		 338 aa  301  9e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  47.2 
 
 		 340 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3049  uridine diphosphate N-acetylgalactosamine 4-epimerase  46.67 
 
 		 335 aa  301  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200753  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0734  UDP-galactose 4-epimerase  47.01 
 
 		 339 aa  301  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3310  UDP-glucose 4-epimerase  47.73 
 
 		 340 aa  300  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138688  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  46.33 
 
 		 353 aa  300  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  47.88 
 
 		 337 aa  300  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3183  UDP-glucose 4-epimerase  44.71 
 
 		 339 aa  300  3e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.670308 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1250  UDP-galactose-4-epimerase  45.65 
 
 		 338 aa  300  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  44.88 
 
 		 340 aa  300  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  47.27 
 
 		 336 aa  299  4e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0107  UDP-galactose 4-epimerase  45.02 
 
 		 343 aa  299  5e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  47.27 
 
 		 337 aa  299  5e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  47.58 
 
 		 338 aa  298  6e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1161  UDP-glucose 4-epimerase  45.48 
 
 		 338 aa  298  7e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0299848  hitchhiker  0.000414813 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0812  UDP-galactose-4-epimerase  45.05 
 
 		 338 aa  298  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  45.95 
 
 		 334 aa  298  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3082  UDP-glucose 4-epimerase  47.6 
 
 		 339 aa  298  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0926  UDP-galactose-4-epimerase  45.05 
 
 		 338 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0730766 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  45.02 
 
 		 336 aa  297  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>