30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4102 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4102  PKD domain containing protein  100 
 
 		 295 aa  611  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.774924  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4876  PKD domain containing protein  33.97 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480301  normal  0.596683 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3280  PKD domain-containing protein  24.85 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  26.92 
 
 		 978 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  25.17 
 
 		 1292 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  25.38 
 
 		 1682 aa  49.3  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  27.89 
 
 		 1969 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  27.08 
 
 		 786 aa  47  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  26.01 
 
 		 551 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  25.83 
 
 		 930 aa  47  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  28 
 
 		 1667 aa  47  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1001 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  27.91 
 
 		 1241 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  23.87 
 
 		 1300 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  25.43 
 
 		 752 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  28.81 
 
 		 941 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  25.33 
 
 		 1094 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4679  PKD domain-containing protein  27.91 
 
 		 1367 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  26.23 
 
 		 963 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  24.6 
 
 		 940 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  24.48 
 
 		 1011 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3754  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1830 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.301903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  30.65 
 
 		 1361 aa  43.5  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  24.65 
 
 		 859 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  24.84 
 
 		 1882 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  25.66 
 
 		 1120 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  32.53 
 
 		 861 aa  42.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  28.68 
 
 		 2272 aa  42.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  26.35 
 
 		 2036 aa  42.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  25.85 
 
 		 679 aa  42.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>