38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37160 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_37160  beta-galactosidase  100 
 
 		 832 aa  1616    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14250  beta-galactosidase  43.85 
 
 		 802 aa  480  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.507972  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3250  Beta-galactosidase  39.41 
 
 		 796 aa  430  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1364  Beta-galactosidase  36.22 
 
 		 827 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1479  Beta-galactosidase  30.62 
 
 		 801 aa  288  4e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.988744  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0258  Beta-galactosidase  30.61 
 
 		 898 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.178588 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  36.76 
 
 		 780 aa  133  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01626  beta-galactosidase  43.15 
 
 		 613 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453001  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4556  Beta-galactosidase  38.51 
 
 		 610 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108678  normal  0.0283315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7101  Beta-galactosidase  30.95 
 
 		 625 aa  127  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2925  Beta-galactosidase  38.29 
 
 		 799 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0350  beta-galactosidase  26.55 
 
 		 598 aa  125  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2009  Beta-galactosidase  40.24 
 
 		 612 aa  123  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.237647  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1933  Beta-galactosidase  40.24 
 
 		 612 aa  123  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5411  Beta-galactosidase  29.1 
 
 		 586 aa  111  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42814  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04160  beta-galactosidase  37.97 
 
 		 631 aa  110  9.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3570  Beta-galactosidase  36.46 
 
 		 586 aa  108  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7453  Beta-galactosidase  39.44 
 
 		 576 aa  108  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13150  beta-galactosidase  36.63 
 
 		 586 aa  105  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0900  Beta-galactosidase  23.92 
 
 		 892 aa  98.2  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.698907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27720  beta-galactosidase  34.92 
 
 		 924 aa  97.8  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.23189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4420  Beta-galactosidase  27.54 
 
 		 584 aa  97.4  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.574053 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6542  Beta-galactosidase  32.78 
 
 		 632 aa  97.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.638315  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0104  Beta-galactosidase  32.4 
 
 		 584 aa  96.3  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114999 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0941  glycosyl hydrolase, putative  34.48 
 
 		 808 aa  95.1  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2576  Beta-galactosidase  36.78 
 
 		 579 aa  94.7  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  32.53 
 
 		 1392 aa  94  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0771  Beta-galactosidase  32 
 
 		 643 aa  93.6  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1050  Beta-galactosidase  36.42 
 
 		 580 aa  91.7  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869606  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00756  beta-galactosidase (Eurofung)  30.22 
 
 		 985 aa  86.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.688581 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45673  beta-galactosidase  34.64 
 
 		 951 aa  83.2  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0079  glycoside hydrolase family 35  32.08 
 
 		 739 aa  78.6  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.579135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2392  Beta-galactosidase  30.36 
 
 		 672 aa  75.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3398  glycoside hydrolase family 35  33.14 
 
 		 837 aa  75.1  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00980  beta-galactosidase (Eurofung)  29.61 
 
 		 996 aa  72.4  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.938367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3535  Beta-galactosidase-like protein  34.31 
 
 		 682 aa  57.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6638  glycoside hydrolase family 35  35.48 
 
 		 644 aa  52  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119053  hitchhiker  0.0000205681 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2665  glycoside hydrolase family 35  29.56 
 
 		 534 aa  48.1  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>