83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31270 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_31270  flagellar biosynthetic protein FliS  100 
 
 
153 aa  305  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226218  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2033  flagellar protein FliS  53.33 
 
 
153 aa  138  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.992226 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0983  flagellar protein FliS  54.1 
 
 
128 aa  133  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869228  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1628  flagellar protein FliS  51.02 
 
 
138 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2996  flagellar protein FliS  51.24 
 
 
172 aa  124  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010137 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0836  flagellar protein FliS  49.15 
 
 
137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289358  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2352  flagellar protein FliS  48.67 
 
 
132 aa  110  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0764  flagellar protein FliS  44.74 
 
 
129 aa  96.3  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  33.06 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  32.23 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0821  flagellar protein FliS  33.88 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  32.5 
 
 
136 aa  72  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  29.73 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0106  flagellar protein FliS  35.14 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0288996  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0232  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  29.66 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000726732  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2415  flagellar protein FliS  32.76 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0255  flagellar protein FliS  34.07 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3014  flagellar protein FliS  32.11 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.896299  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2228  flagellar protein FliS  32.73 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000248624 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1784  flagellar protein FliS  33.04 
 
 
134 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17030  flagellar protein FliS  31.07 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0465  flagellar protein FliS  29.63 
 
 
129 aa  62.8  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000775851  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1652  flagellar protein FliS  30.36 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2217  flagellar protein FliS  31.53 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3200  flagellar protein FliS  31.19 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0033  flagellar protein FliS  32.26 
 
 
133 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0115  flagellar protein FliS  37.7 
 
 
125 aa  57.4  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.906017  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0827  flagellar protein FliS  31.94 
 
 
154 aa  57  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1111  flagellar protein FliS  29.1 
 
 
143 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0777  flagellar protein FliS  30.77 
 
 
123 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0445  flagellar protein FliS  30.43 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0313  flagellar protein FliS  31.37 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0667  flagellar protein FliS  30.56 
 
 
123 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3036  flagellar protein FliS  31.97 
 
 
144 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0560  flagellar protein FliS  26.92 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1036  flagellar protein FliS  32.29 
 
 
98 aa  50.4  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.242912  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0119  flagellar protein FliS  27.73 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.759612  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0086  flagellar protein FliS  31.07 
 
 
173 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.639004 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2521  flagellar protein FliS  30.1 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00148899  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1148  flagellar protein FliS  27.62 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  29.37 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2864  flagellar protein  31.03 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.870438  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  29.46 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  28.57 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0634  flagellar protein FliS  25.81 
 
 
152 aa  47.8  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323334 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0995  flagellar protein FliS  23.08 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4093  flagellar protein FliS  30.19 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1983  flagellar protein FliS  30.33 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  25.89 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2937  flagellar protein FliS  27.21 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.706252  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  32.48 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0620  flagellar protein FliS  30.91 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5092  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0766  flagellar protein FliS  27.27 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049999 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1256  flagellar protein FliS  29.63 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.25928 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2700  flagellar protein FliS  29.63 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.11516 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24260  flagellar protein FliS  29.91 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4165  flagellar protein FliS  23.21 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0091  flagellar protein FliS  29.52 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1721  flagellar protein FliS  28.7 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.649676  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  27.78 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2160  flagellar protein FliS  28.7 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5255  flagellar protein potentiates polymerization, flagellar protein FliS  29.77 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0356496 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  28.57 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0781  flagellar protein FliS  28.07 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2025  flagellar protein FliS  28.7 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1714  flagellar protein FliS  28.7 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.16255 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1055  flagellar protein FliS  28.7 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216537  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  30.28 
 
 
135 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  30.28 
 
 
135 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  30.28 
 
 
135 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  30.28 
 
 
135 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3037  flagellar protein FliS  25.23 
 
 
142 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  30.28 
 
 
135 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3084  flagellar protein FliS  35.06 
 
 
146 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.933377  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3936  flagellar protein FliS  29.25 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  29.31 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0574  flagellar protein FliS  30.1 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.80072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3810  flagellar protein FliS  28.93 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2120  flagellar protein FliS  28.18 
 
 
301 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.472713  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0653  flagellar protein FliS  29.81 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3849  hypothetical protein  27.59 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1381  flagellar protein FliS  29.81 
 
 
128 aa  41.2  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>