43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18680 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_18680  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  337  4e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194491  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3032  hypothetical protein  58.25 
 
 		 155 aa  114  8.999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0458  hypothetical protein  39.08 
 
 		 175 aa  95.9  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0600  hypothetical protein  43.26 
 
 		 143 aa  94.4  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0900  hypothetical protein  43.08 
 
 		 149 aa  91.3  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2110  putative thioredoxin  40.52 
 
 		 152 aa  90.9  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0349096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0447  thioredoxin-related  48.91 
 
 		 146 aa  88.6  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4232  putative thioredoxin  50 
 
 		 170 aa  85.1  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514509  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37690  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  42.66 
 
 		 145 aa  83.6  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6171  thioredoxin domain-containing protein  44.83 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4352  Thioredoxin domain protein  46.15 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.289078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4643  thioredoxin  47.47 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81878  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4375  hypothetical protein  43.86 
 
 		 141 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1559  putative thioredoxin  45.36 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.832345  hitchhiker  0.00666422 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4910  thioredoxin domain-containing protein  30.28 
 
 		 140 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5099  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4614  thioredoxin domain-containing protein  30.28 
 
 		 140 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10831  thioredoxin thiX  33.33 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220535 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4527  thioredoxin domain-containing protein  30.28 
 
 		 140 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1648  thioredoxin domain-containing protein  31.16 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0259266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6826  hypothetical protein  35.96 
 
 		 140 aa  48.5  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl178  thioredoxin  28.4 
 
 		 102 aa  47.8  0.00007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  30.85 
 
 		 107 aa  45.1  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  36.25 
 
 		 176 aa  44.7  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0517  thioredoxin-related protein  29.41 
 
 		 125 aa  44.7  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  29.47 
 
 		 107 aa  44.7  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  21.88 
 
 		 98 aa  44.3  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1185  Thioredoxin domain  28.77 
 
 		 125 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  30.59 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0435  thioredoxin domain-containing protein  30.49 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2886  thioredoxin domain-containing protein  26.09 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  42.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0855  Fis family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 130 aa  42.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1040  Thioredoxin domain protein  31.13 
 
 		 167 aa  42  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1854  thioredoxin  32.53 
 
 		 102 aa  42.4  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  29.17 
 
 		 107 aa  42  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1878  Thioredoxin domain protein  30.26 
 
 		 125 aa  41.6  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  41.6  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2957  thioredoxin family protein  28.24 
 
 		 125 aa  41.2  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  30.59 
 
 		 112 aa  41.2  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  23.47 
 
 		 98 aa  40.8  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1144  thioredoxin  29.31 
 
 		 421 aa  40.8  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  26.74 
 
 		 104 aa  40.8  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>