More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13850 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13850  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 356 aa  717    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1528  transcriptional regulator, LacI family  76.02 
 
 		 356 aa  541  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126847  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2175  transcriptional regulator, LacI family  68.56 
 
 		 349 aa  476  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.408939  normal  0.717598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0746  LacI family transcription regulator  62.69 
 
 		 360 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506865 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2163  transcriptional regulator, LacI family  63.5 
 
 		 355 aa  427  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.130175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3343  LacI family transcription regulator  60.24 
 
 		 349 aa  420  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716413  normal  0.0750883 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1882  LacI family transcriptional regulator  60.84 
 
 		 343 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.711539 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0802  alanine racemase  62.94 
 
 		 368 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3351  LacI family transcription regulator  59.41 
 
 		 354 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  decreased coverage  0.0034898 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0834  LacI family transcription regulator  61.45 
 
 		 347 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1780  transcriptional regulator, LacI family  61.83 
 
 		 345 aa  410  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2112  transcriptional regulator, LacI family  59.7 
 
 		 350 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0696  transcriptional regulator, LacI family  59.76 
 
 		 357 aa  398  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.477401 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11580  transcriptional regulator, LacI family  58.98 
 
 		 345 aa  390  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1131  transcriptional regulator, LacI family  57.88 
 
 		 332 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5892  transcriptional regulator, LacI family  59.16 
 
 		 332 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.369057 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3766  LacI family transcription regulator  56.19 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3324  LacI family transcription regulator  56.97 
 
 		 347 aa  358  7e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370251  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5857  transcriptional regulator, LacI family  54.98 
 
 		 338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.55822 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27370  transcriptional regulator, LacI family  51.34 
 
 		 339 aa  332  5e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0316556  normal  0.625648 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03820  transcriptional regulator, LacI family  51.81 
 
 		 333 aa  323  2e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.048726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8463  transcriptional regulator, LacI family  48.19 
 
 		 350 aa  321  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5410  LacI family transcription regulator  47.87 
 
 		 340 aa  320  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6898  LacI family transcription regulator  48.63 
 
 		 326 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0061  transcriptional regulator, LacI family  49.55 
 
 		 341 aa  315  7e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408611  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3704  transcriptional regulator, LacI family  48.38 
 
 		 353 aa  313  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00247071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3511  transcriptional regulator, LacI family  48.64 
 
 		 341 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0677107  normal  0.351268 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3510  transcriptional regulator, LacI family  48.95 
 
 		 340 aa  293  5e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0130099  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3705  transcriptional regulator, LacI family  47.18 
 
 		 340 aa  267  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0259788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0347  transcriptional regulator, LacI family  43.23 
 
 		 347 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12300  transcriptional regulator  42 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.194881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0937  ribose operon repressor RbsR  40.18 
 
 		 334 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.53 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  35.42 
 
 		 326 aa  180  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  33.83 
 
 		 337 aa  179  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2046  LacI family transcription regulator  34.5 
 
 		 344 aa  177  4e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.64 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.82 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.85 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.23 
 
 		 330 aa  173  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  31.34 
 
 		 335 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5848  LacI family transcription regulator  34.42 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1905  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 355 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  31.55 
 
 		 355 aa  170  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 340 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  31.63 
 
 		 342 aa  169  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  34.9 
 
 		 353 aa  169  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  31.52 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  34.62 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  34.62 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  30.77 
 
 		 331 aa  166  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  35.52 
 
 		 343 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 		 348 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.02 
 
 		 342 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.02 
 
 		 342 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  29.68 
 
 		 347 aa  166  8e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  33.81 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  34.31 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0975  transcriptional regulator, LacI family  33.14 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  36.51 
 
 		 337 aa  163  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  33.73 
 
 		 343 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 361 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00440  transcriptional regulator, LacI family  31.83 
 
 		 338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.55 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  34.62 
 
 		 343 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  31.3 
 
 		 342 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  34.62 
 
 		 343 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  31.56 
 
 		 348 aa  162  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  34.62 
 
 		 343 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  34.62 
 
 		 343 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  32.75 
 
 		 354 aa  162  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  33.72 
 
 		 346 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 		 343 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  34.09 
 
 		 352 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 		 343 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 		 343 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  31.83 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4596  transcriptional regulator, LacI family  34.19 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0502076 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 		 343 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  32.13 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  33.14 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  32.66 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  31.53 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2320  LacI family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 340 aa  159  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316441  normal  0.202359 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  31.53 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  31.83 
 
 		 323 aa  159  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  31.83 
 
 		 323 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  32.75 
 
 		 335 aa  159  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3025  transcriptional regulator, LacI family  34.68 
 
 		 347 aa  159  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  28.37 
 
 		 347 aa  159  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  35.01 
 
 		 391 aa  159  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  31.83 
 
 		 323 aa  159  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  31.83 
 
 		 323 aa  159  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  31.83 
 
 		 323 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  32.93 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0309  LacI family transcription regulator  32.27 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543523  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  32.84 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.84 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.84 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>