55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_06540 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_06540  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  254  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0931941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0698  hypothetical protein  42.74 
 
 		 210 aa  95.5  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.677149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0836  hypothetical protein  35.88 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2286  hypothetical protein  36.11 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0149  hypothetical protein  31.48 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.162646 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01895  hypothetical protein  33.08 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1975  hypothetical protein  36.21 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117917 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2198  hypothetical protein  31.3 
 
 		 187 aa  67.4  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0957068  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2238  hypothetical protein  34.48 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.093241  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4452  hypothetical protein  32.76 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4385  hypothetical protein  34.75 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6109  hypothetical protein  35.4 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70400  hypothetical protein  35.4 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2185  hypothetical protein  29.36 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000358474  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12390  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00297914  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0214  hypothetical protein  37.97 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5201  hypothetical protein  31.25 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402389  normal  0.38056 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2895  hypothetical protein  36.79 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5293  hypothetical protein  31.25 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.44714 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5546  hypothetical protein  27.83 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3837  hypothetical protein  33.04 
 
 		 225 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120142  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0699  hypothetical protein  26.85 
 
 		 442 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0078  hypothetical protein  28.46 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3457  hypothetical protein  30.43 
 
 		 113 aa  50.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.442595 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0837  hypothetical protein  27.83 
 
 		 208 aa  50.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.890275  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4122  hypothetical protein  26.79 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2891  hypothetical protein  27.88 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2511  hypothetical protein  27.88 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2816  hypothetical protein  37.66 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17320  hypothetical protein  29.6 
 
 		 243 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.755634  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02323  hypothetical protein  28.41 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000435159  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4796  hypothetical protein  28.43 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986952 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1684  hypothetical protein  29.06 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.43716  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02860  hypothetical protein  31.82 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0386  hypothetical protein  28.57 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.955149  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2214  hypothetical protein  38.33 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.405155  normal  0.0116481 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0278  hypothetical protein  27.93 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0281  hypothetical protein  27.93 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083962  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0282  hypothetical protein  27.93 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.844677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0274  hypothetical protein  27.93 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0084  hypothetical protein  27.47 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00233464  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4455  hypothetical protein  26.37 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2606  hypothetical protein  28.41 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.209325  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4405  hypothetical protein  28.26 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.062557 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4034  hypothetical protein  28.26 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.714126  normal  0.124652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3408  hypothetical protein  37.29 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0271  hypothetical protein  26.97 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  hitchhiker  0.000000928921 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0079  hypothetical protein  29.41 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3751  hypothetical protein  26.97 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.855057  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0270  hypothetical protein  26.97 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.280793  hitchhiker  0.0000338917 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3532  membrane protein  27.59 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22213  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11670  hypothetical protein  23.13 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0590799  normal  0.654149 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0497  hypothetical protein  38.16 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.980208  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2587  hypothetical protein  41.51 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000426932  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0007  hypothetical protein  27.27 
 
 		 127 aa  40.4  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146803  normal  0.457829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>