More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_06100 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_06100  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  100 
 
 		 228 aa  459  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.214658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  35.55 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  38.1 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  39.9 
 
 		 215 aa  123  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  36.45 
 
 		 219 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1188  class II aldolase/adducin family protein  37.8 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0647898  normal  0.0283985 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0395  L-fuculose phosphate aldolase  33 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0442  L-fuculose phosphate aldolase  33 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4923  L-fuculose phosphate aldolase  33 
 
 		 213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191657  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0444  L-fuculose phosphate aldolase  33 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0328  L-fuculose phosphate aldolase  32.02 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0333  L-fuculose phosphate aldolase  33 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.618561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0317  L-fuculose phosphate aldolase  33 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0320  L-fuculose phosphate aldolase  33 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.4164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0380  L-fuculose phosphate aldolase  33 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  33 
 
 		 212 aa  108  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  33 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2227  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  35.11 
 
 		 214 aa  106  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2887  class II aldolase/adducin family protein  35.58 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0348  L-fuculose phosphate aldolase  32.51 
 
 		 213 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  32.18 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  32.34 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6218  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  35.96 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.948817 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  33.99 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  34.52 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  33.68 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  34.13 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4714  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  37.13 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0381  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  34.39 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3232  L-fuculose-1-phosphate aldolase  35.14 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4596  Fis family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  31.55 
 
 		 207 aa  99.4  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3663  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  34.98 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2364  L-fuculose phosphate aldolase (class II)  33.82 
 
 		 218 aa  98.2  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0359  class II aldolase/adducin-like  33.33 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1025  L-fuculose-phosphate aldolase  33.82 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.916457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  31 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4089  class II aldolase/adducin family protein  39.31 
 
 		 234 aa  95.9  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117914 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2157  class II aldolase/adducin family protein  32.7 
 
 		 222 aa  95.5  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3550  class II aldolase/adducin family protein  32.84 
 
 		 214 aa  95.1  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  32.84 
 
 		 222 aa  94.7  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0497  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  34.97 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.591725 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29510  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  33.19 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1122  class II aldolase/adducin family protein  31.92 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.404632 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5136  L-fuculose-phosphate aldolase  32.7 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4810  class II aldolase/adducin family protein  34.74 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.86803  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4066  class II aldolase/adducin family protein  33.65 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1019  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  31.39 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1862  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  31.53 
 
 		 217 aa  92.8  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  34.15 
 
 		 216 aa  92.8  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  31.41 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  30.58 
 
 		 216 aa  92  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0040  class II aldolase/adducin family protein  34.81 
 
 		 212 aa  91.7  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104047  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  28.5 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4174  L-fuculose-phosphate aldolase  27.72 
 
 		 218 aa  90.9  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2019  L-fuculose-phosphate aldolase  33.04 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0380  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  33.66 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  32.04 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0402  class II aldolase/adducin family protein  32.84 
 
 		 223 aa  90.1  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1884  L-fuculose phosphate aldolase  31.25 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2684  class II aldolase/adducin family protein  34.93 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  0.449845 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0476  L-fuculose-phosphate aldolase  31.66 
 
 		 214 aa  89.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2128  L-fuculose-phosphate aldolase  31.66 
 
 		 214 aa  89.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3384  class II aldolase/adducin family protein  32.43 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0243  class II aldolase/adducin family protein  33.64 
 
 		 226 aa  88.6  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365034  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1656  aminotransferase  32.14 
 
 		 753 aa  88.6  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12102  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0629  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  34.18 
 
 		 212 aa  88.2  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2754  class II aldolase/adducin family protein  32.85 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0172174  decreased coverage  0.00000252698 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1149  class II aldolase/adducin family protein  35.2 
 
 		 215 aa  88.2  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0654  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  34.18 
 
 		 212 aa  88.2  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2398  L-fuculose-phosphate aldolase  31.37 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.064801  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1224  class II aldolase/adducin family protein  32.55 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0872  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  33.5 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1036  class II aldolase/adducin family protein  33.69 
 
 		 201 aa  86.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3273  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  34.2 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0199942 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1734  class II aldolase/adducin family protein  31.65 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0005508  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1228  putative L-fuculose phosphate aldolase  33.16 
 
 		 224 aa  85.9  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642951  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  31.09 
 
 		 215 aa  85.1  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2248  class II aldolase/adducin family protein  30.29 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.589142  normal  0.160982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1876  class II aldolase/adducin family protein  30 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.313117  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2791  L-fuculose-phosphate aldolase  31.4 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3336  class II aldolase/adducin, N-terminal  29.76 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348459 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06950  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  33.99 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0223  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  31.25 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2573  L-fuculose-phosphate aldolase  30 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2778  L-fuculose-phosphate aldolase  32.02 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  30.26 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0324  class II aldolase/adducin family protein  29.57 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2482  class II aldolase/adducin family protein  27.88 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000186834  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0750  class II aldolase/adducin family protein  35.41 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2268  class II aldolase/adducin family protein  33.52 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.043365 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0888  L-fuculose phosphate aldolase  31.19 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4064  L-fuculose phosphate aldolase  31.19 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5314  L-fuculose-phosphate aldolase  31.46 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521984  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10741  L-fuculose-phosphate aldolase  30.89 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.4342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2944  L-fuculose phosphate aldolase  31.19 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.818387  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3182  L-fuculose phosphate aldolase  32.2 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.259088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3197  L-fuculose phosphate aldolase  32.2 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3117  L-fuculose phosphate aldolase  32.2 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0963126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>