More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2196 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2040  DNA-directed DNA polymerase  75.84 
 
 		 418 aa  664    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939043  normal  0.0886472 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3235  DNA-directed DNA polymerase  74.4 
 
 		 418 aa  673    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2605  DNA-directed DNA polymerase  80.14 
 
 		 418 aa  719    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.733552  normal  0.0235112 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2120  DNA-repair protein  98.23 
 
 		 339 aa  693    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3210  DNA-directed DNA polymerase  75.6 
 
 		 418 aa  680    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000012227 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2196  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 418 aa  875    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1964  DNA-directed DNA polymerase  73.21 
 
 		 418 aa  655    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3453  DNA-directed DNA polymerase  73.92 
 
 		 418 aa  660    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00650413  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4268  DNA-directed DNA polymerase  75.6 
 
 		 418 aa  657    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3553  DNA-directed DNA polymerase  74.4 
 
 		 418 aa  666    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4407  DNA-directed DNA polymerase  75.6 
 
 		 418 aa  657    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1832  DNA-repair protein  93.78 
 
 		 418 aa  832    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0012  SOS mutagenesis protein RulB  69.86 
 
 		 418 aa  628  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374057  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2171  DNA-directed DNA polymerase  67.22 
 
 		 417 aa  589  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2195  DNA-directed DNA polymerase  66.03 
 
 		 417 aa  580  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.147122  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08269  DNA-directed DNA polymerase  61.24 
 
 		 418 aa  550  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2466  DNA-repair protein  62.44 
 
 		 417 aa  535  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0312138  normal  0.965014 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4598  DNA-repair protein  61.63 
 
 		 418 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000181511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4570  DNA-repair protein  61.63 
 
 		 418 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4414  DNA-repair protein  61.63 
 
 		 418 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000291737  decreased coverage  0.00359939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2682  umuC protein  51.2 
 
 		 418 aa  430  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261647  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1636  umuC protein  49.04 
 
 		 417 aa  420  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2344  DNA-directed DNA polymerase  50.47 
 
 		 421 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2284  DNA-directed DNA polymerase  71.09 
 
 		 256 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.456765  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4172  DNA-directed DNA polymerase  47 
 
 		 416 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.06239 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4349  umuC protein  80.09 
 
 		 221 aa  371  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.844535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2606  DNA-directed DNA polymerase  41.47 
 
 		 422 aa  323  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.4458 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2162  DNA polymerase V subunit UmuC  42.15 
 
 		 422 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.229342 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01159  DNA polymerase V subunit UmuC  41.78 
 
 		 422 aa  318  9e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000022565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2464  DNA-directed DNA polymerase  41.78 
 
 		 422 aa  318  9e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050901  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01169  hypothetical protein  41.78 
 
 		 422 aa  318  9e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000148835  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2441  DNA polymerase V subunit UmuC  41.78 
 
 		 422 aa  318  9e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000365295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1329  DNA polymerase V subunit UmuC  41.78 
 
 		 422 aa  318  9e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024147  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1287  DNA polymerase V subunit UmuC  41.78 
 
 		 422 aa  318  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000534988  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0172  DNA-repair protein  69.38 
 
 		 218 aa  318  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2158  DNA polymerase V subunit UmuC  41.92 
 
 		 422 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.512063  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1671  DNA polymerase V subunit UmuC  41.55 
 
 		 422 aa  316  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0525212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1965  DNA polymerase V subunit UmuC  41.55 
 
 		 422 aa  316  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000119892  normal  0.867639 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2215  DNA polymerase V subunit UmuC  41.92 
 
 		 422 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69246  normal  0.844364 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1982  DNA-directed DNA polymerase  41.37 
 
 		 423 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2212  DNA polymerase V subunit UmuC  40.98 
 
 		 422 aa  306  3e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1908  DNA-directed DNA polymerase  41.23 
 
 		 420 aa  302  8.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2342  DNA-directed DNA polymerase  40.43 
 
 		 424 aa  302  9e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2353  DNA-directed DNA polymerase  40.9 
 
 		 424 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2458  DNA-directed DNA polymerase  40.43 
 
 		 424 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2005  DNA-directed DNA polymerase  40.66 
 
 		 424 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000515421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1751  umuC protein  40.05 
 
 		 427 aa  299  8e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5030  DNA-directed DNA polymerase  38.92 
 
 		 426 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2106  DNA-directed DNA polymerase  39.81 
 
 		 421 aa  292  9e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2950  DNA-directed DNA polymerase  38.92 
 
 		 424 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0052  DNA-directed DNA polymerase  35.78 
 
 		 449 aa  290  4e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154189 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0705  DNA-directed DNA polymerase  36.82 
 
 		 450 aa  288  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2745  DNA-directed DNA polymerase  38.77 
 
 		 424 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1492  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  37.5 
 
 		 420 aa  285  8e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00564635  decreased coverage  0.000128837 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0053  mutagenesis and repair protein MucB  39.01 
 
 		 421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000259717  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1425  DNA-directed DNA polymerase  38.3 
 
 		 426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0055  hypothetical protein  37.94 
 
 		 425 aa  283  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.352875  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1279  DNA-directed DNA polymerase  39.72 
 
 		 423 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4000  DNA-directed DNA polymerase  40.14 
 
 		 430 aa  281  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1369  DNA-directed DNA polymerase  38.32 
 
 		 426 aa  280  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.772919  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0886  DNA-directed DNA polymerase  38.94 
 
 		 439 aa  281  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10658  putative RumB/ImpB like DNA repair protein  36.56 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0002  DNA polymerase V subunit UmuC  38.92 
 
 		 423 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3752  DNA-directed DNA polymerase  36.43 
 
 		 420 aa  280  4e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2761  DNA-directed DNA polymerase  39.29 
 
 		 426 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0282343 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1040  hypothetical protein  37.5 
 
 		 425 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1005  hypothetical protein  37.65 
 
 		 425 aa  277  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1668  hypothetical protein  40.05 
 
 		 418 aa  276  7e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1662  hypothetical protein  40.05 
 
 		 418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0898  DNA-directed DNA polymerase  37.83 
 
 		 437 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.694521 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0036  DNA polymerase V subunit UmuC  38.39 
 
 		 424 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0503759 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1369  DNA-directed DNA polymerase  36.36 
 
 		 426 aa  270  5e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4341  DNA-directed DNA polymerase  35.71 
 
 		 432 aa  269  8e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0759  DNA-directed DNA polymerase  38.08 
 
 		 423 aa  268  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3841  DNA-directed DNA polymerase  36.49 
 
 		 437 aa  267  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1966  DNA-directed DNA polymerase  34.52 
 
 		 446 aa  265  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.577995  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7046  UMUC domain protein DNA-repair protein  37.65 
 
 		 442 aa  263  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1550  DNA-directed DNA polymerase  36.28 
 
 		 418 aa  262  6e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0477659 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6848  DNA-directed DNA polymerase  35.65 
 
 		 422 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615058  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4983  UMUC-like DNA-repair protein  36.01 
 
 		 432 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000315583 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1434  DNA-directed DNA polymerase  36.84 
 
 		 497 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0220  DNA-directed DNA polymerase  36.26 
 
 		 436 aa  260  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2378  DNA-directed DNA polymerase  35.9 
 
 		 425 aa  258  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3075  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  36.36 
 
 		 419 aa  256  7e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4321  DNA-directed DNA polymerase  36.02 
 
 		 428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.466657 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0859  DNA-directed DNA polymerase  34.81 
 
 		 450 aa  253  6e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0175  DNA-directed DNA polymerase  37.2 
 
 		 423 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4498  DNA-directed DNA polymerase  35.55 
 
 		 426 aa  252  8.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1338  umuC protein  36.62 
 
 		 432 aa  252  9.000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2200  DNA-directed DNA polymerase  37.79 
 
 		 424 aa  251  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6255  DNA-directed DNA polymerase  35.61 
 
 		 442 aa  249  6e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.983679 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1031  DNA-directed DNA polymerase  35.13 
 
 		 426 aa  247  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3517  DNA-directed DNA polymerase  36.32 
 
 		 478 aa  238  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2973  DNA-directed DNA polymerase  34.09 
 
 		 492 aa  237  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0296388  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1335  DNA-directed DNA polymerase  34.35 
 
 		 419 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0920  DNA-directed DNA polymerase  34.12 
 
 		 423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.21788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07071  putative UmuC protein  34.43 
 
 		 422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.109713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0315  DNA-directed DNA polymerase  35.95 
 
 		 443 aa  233  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.639091 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3536  DNA-repair protein  34.37 
 
 		 418 aa  230  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15961  putative UmuC protein  34.2 
 
 		 424 aa  229  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>