33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1767 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1767  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  472  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.834919  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1795  hypothetical protein  89.33 
 
 		 225 aa  418  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1443  hypothetical protein  85.12 
 
 		 215 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1691  hypothetical protein  53.05 
 
 		 220 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.669152  normal  0.0131233 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3513  transposase  39.55 
 
 		 222 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3328  conserved hypothetical protein  40.7 
 
 		 208 aa  149  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1718  hypothetical protein  38.31 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1252  transposase  36.87 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0590866  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1049  conserved hypothetical protein  38.14 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4754  transposase  37 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570232  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2954  hypothetical protein  34.6 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.399197  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0924  CP4-57 prophage; hypothetical protein  38.07 
 
 		 207 aa  118  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00353678  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1393  hypothetical protein  35.98 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001841  hypothetical protein  37.9 
 
 		 220 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2132  hypothetical protein  35.83 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1077  hypothetical protein  35.29 
 
 		 189 aa  108  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371297 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4884  hypothetical protein  34.41 
 
 		 189 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0762  hypothetical protein  33.68 
 
 		 209 aa  108  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1254  transposase  33.68 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0376  transposase  35.64 
 
 		 202 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.581845  hitchhiker  0.0000248645 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0768  hypothetical protein  33 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1781  hypothetical protein  34.92 
 
 		 198 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0242825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3395  hypothetical protein  32.34 
 
 		 243 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4689  hypothetical protein  29.91 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3198  hypothetical protein  29.91 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4793  hypothetical protein  29.06 
 
 		 243 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1404  hypothetical protein  42.86 
 
 		 72 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3782  hypothetical protein  27.55 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.756711 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2681  hypothetical protein  30.63 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0631191  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0280  hypothetical protein  27.91 
 
 		 360 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000851803  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2018  hypothetical protein  25.87 
 
 		 274 aa  45.8  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0384  hypothetical protein  24.39 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2858  hypothetical protein  24.86 
 
 		 187 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30287 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>